Jokirapujen ja täplärapujen esiintymisen selvittäminen eDNA-menetelmällä
Mäkinen, M., Jussila, J., Sjövik, R., Ventelä, E., Kokko, H., Pesonen, A., Ruokonen, T. (2021). Jokirapujen ja täplärapujen esiintymisen selvittäminen eDNA‐menetelmällä. Jyväskylän yliopiston bio- ja ympäristötieteiden laitoksen tiedonantoja.1. Jyväskylän yliopisto. URN: URN:ISBN:978-951-39-8929-3
Julkaistu sarjassa
Jyväskylän yliopiston bio- ja ympäristötieteiden laitoksen tiedonantojaTekijät
Päivämäärä
2021Tekijänoikeudet
© KIrjoittajat & Jyväskylän yliopisto, 2021
Vaarantuneiden jokirapukantojen uhkana on vesistöihimme hyvin sopeutunut vieraslaji, täplärapu, ja sen kantama, erityisesti jokiravuille kohtalokas rapuruton muoto.
Rapupopulaatioiden paikantaminen ja seuranta on perinteisesti perustunut paikallistietoon ja koeravustuksiin. Viime vuosien aikana ympäristö-DNA:n (eDNA) käyttöön
perustuvat menetelmät ovat kehittyneet varteenotettavaksi vaihtoehdoksi perinteisten menetelmien rinnalle. eDNA-menetelmän avulla voidaan vesinäytteestä tunnistaa
kohde-eliöt molekyylibiologisin menetelmin. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli
selvittää, soveltuuko eDNA-menetelmä käytettäväksi rapupopulaatioiden havainnoinnissa suomalaisissa vesistöissä ja verrata saatuja tuloksia perinteisiin havainnointimenetelmiin. Valtaosassa kohteista mertapyynti ja eDNA tuottivat havaittujen lajien
osalta saman tuloksen. Osassa kohteita kuitenkin havaittiin eDNA-menetelmällä viitteitä joki- ja täpläravuista, mutta niitä ei saatu mertapyynnissä saaliiksi. Lisäksi osassa
kohteista havaittiin myös rapuruttoa aiheuttavan Aphanomyces astaci -sienen DNA:ta.
Mertapyyntiin verrattuna eDNA-menetelmä on työmäärältään kevyempi ja rapuruton leviämisriski on menetelmää käytettäessä pienempi. On kuitenkin huomioitava,
että mertapyynnillä saatavaa rapukannan tiheysarviota ei eDNA-menetelmän avulla
kyetä luotettavasti tuottamaan. Kuitenkin eDNA-menetelmän käyttö yhdistettynä
paikallistietämykseen on tehokas rapupopulaatioiden havainnointiin.
...
Locating and monitoring crayfish populations have traditionally been based on
test trappings and citizen observations. Over the past years, methods based on
the use of environmental DNA (eDNA) have evolved into a credible alternative
alongside traditional methods. Using the molecular biological eDNA method it
is possible to identify the presence of the target organisms in the sampled water
bodies. The purpose of this study was to determine whether the eDNA method
is suitable for identifying crayfish populations in Finnish waters and to compare
the results obtained with traditional methods. In most study sites, test trappings
and eDNA sampling produced the same result. However, from some of the sites
the eDNA method indicated presence of crayfish, while trapping yielded no
catch. In addition, the eDNA method detected also Aphanomyces astaci DNA in
some sites. A. astaci is the causative agent of crayfish plague. Compared with
trapping, eDNA sampling is lighter in a workload and there is a lower risk of
spreading A. astaci. However, it should be noted that the population density
estimate obtained by trapping cannot be reliably produced by eDNA. However,
the use of eDNA combined with local knowledge is an effective method for
observing crayfish populations.
...
Julkaisija
Jyväskylän yliopistoISBN
978-951-39-8929-3ISSN Hae Julkaisufoorumista
2669-8986Asiasanat
Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedotKokoelmat
- Elektroniset kirjat [554]
Lisenssi
Samankaltainen aineisto
Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.
-
Joki- ja täplärapujen esiintymisen havainnointi eri pyynti- ja näytteenottomenetelmillä
Ventelä, Emmi (2022)Suomessa elää makeissa vesissä kolme rapulajia: luonnonvarainen laji jokirapu (Astacus astacus) sekä istutetut täplärapu (Pacifastacus leniusculus) ja kapeasaksirapu (Pontastacus leptodactylus). Rapuja pyydetään useimmiten ... -
A comparison of the impacts of introduced signal crayfish and native noble crayfish in boreal lake ecosystems
Ercoli, Fabio (University of Jyväskylä, 2014) -
Jokiravun (Astacus astacus) ja täpläravun (Pacifastacus leniusculus) sopeutuminen virtavesiin
Salkonen, Laura (2008) -
Divergent temperature-specific metabolic and feeding rates of native and invasive crayfish
Ruokonen, T. J.; Karjalainen, J. (Springer Science and Business Media LLC, 2022)Temperature is one of the most important factors governing the activity of ectothermic species, and it plays an important but less studied role in the manifestation of invasive species impacts. In this study, we investigated ... -
Lämpötilan vaikutus täpläravun (Pacifastacus leniusculus Dana) kasvuun sekä ravintotiheyden vaikutus täpläravun ja jokiravun (Astacus astacus L.) ravinnonhankintaan
Sjövik, Rosanna (2016)Alun perin pohjoisamerikkalaisen täpläravun (Pacifastacus leniusculus Dana) levinneisyys on 1960-luvulta lähtien laajentunut kattamaan Etelä- ja Keski-Suomessa laajoja vesialueita, jotka ovat aiemmin olleet jokiravun ...
Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.