dc.contributor.author | Mäkinen, Mikko | |
dc.contributor.author | Jussila, Japo | |
dc.contributor.author | Sjövik, Rosanna | |
dc.contributor.author | Ventelä, Emmi | |
dc.contributor.author | Kokko, Harri | |
dc.contributor.author | Pesonen, Aake | |
dc.contributor.author | Ruokonen, Timo J. | |
dc.contributor.editor | | |
dc.date.accessioned | 2021-11-08T08:24:22Z | |
dc.date.available | 2021-11-08T08:24:22Z | |
dc.date.issued | 2021 | |
dc.identifier.citation | Mäkinen, M., Jussila, J., Sjövik, R., Ventelä, E., Kokko, H., Pesonen, A., Ruokonen, T. (2021). Jokirapujen ja täplärapujen esiintymisen selvittäminen eDNA‐menetelmällä. <em>Jyväskylän yliopiston bio- ja ympäristötieteiden laitoksen tiedonantoja</em>.1. Jyväskylän yliopisto. <a href='http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-39-8929-3'>URN: URN:ISBN:978-951-39-8929-3</a> | |
dc.identifier.isbn | 978-951-39-8929-3 | |
dc.identifier.uri | https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/78525 | |
dc.description.abstract | Vaarantuneiden jokirapukantojen uhkana on vesistöihimme hyvin sopeutunut vieraslaji, täplärapu, ja sen kantama, erityisesti jokiravuille kohtalokas rapuruton muoto.
Rapupopulaatioiden paikantaminen ja seuranta on perinteisesti perustunut paikallistietoon ja koeravustuksiin. Viime vuosien aikana ympäristö-DNA:n (eDNA) käyttöön
perustuvat menetelmät ovat kehittyneet varteenotettavaksi vaihtoehdoksi perinteisten menetelmien rinnalle. eDNA-menetelmän avulla voidaan vesinäytteestä tunnistaa
kohde-eliöt molekyylibiologisin menetelmin. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli
selvittää, soveltuuko eDNA-menetelmä käytettäväksi rapupopulaatioiden havainnoinnissa suomalaisissa vesistöissä ja verrata saatuja tuloksia perinteisiin havainnointimenetelmiin. Valtaosassa kohteista mertapyynti ja eDNA tuottivat havaittujen lajien
osalta saman tuloksen. Osassa kohteita kuitenkin havaittiin eDNA-menetelmällä viitteitä joki- ja täpläravuista, mutta niitä ei saatu mertapyynnissä saaliiksi. Lisäksi osassa
kohteista havaittiin myös rapuruttoa aiheuttavan Aphanomyces astaci -sienen DNA:ta.
Mertapyyntiin verrattuna eDNA-menetelmä on työmäärältään kevyempi ja rapuruton leviämisriski on menetelmää käytettäessä pienempi. On kuitenkin huomioitava,
että mertapyynnillä saatavaa rapukannan tiheysarviota ei eDNA-menetelmän avulla
kyetä luotettavasti tuottamaan. Kuitenkin eDNA-menetelmän käyttö yhdistettynä
paikallistietämykseen on tehokas rapupopulaatioiden havainnointiin. | fi |
dc.description.abstract | Locating and monitoring crayfish populations have traditionally been based on
test trappings and citizen observations. Over the past years, methods based on
the use of environmental DNA (eDNA) have evolved into a credible alternative
alongside traditional methods. Using the molecular biological eDNA method it
is possible to identify the presence of the target organisms in the sampled water
bodies. The purpose of this study was to determine whether the eDNA method
is suitable for identifying crayfish populations in Finnish waters and to compare
the results obtained with traditional methods. In most study sites, test trappings
and eDNA sampling produced the same result. However, from some of the sites
the eDNA method indicated presence of crayfish, while trapping yielded no
catch. In addition, the eDNA method detected also Aphanomyces astaci DNA in
some sites. A. astaci is the causative agent of crayfish plague. Compared with
trapping, eDNA sampling is lighter in a workload and there is a lower risk of
spreading A. astaci. However, it should be noted that the population density
estimate obtained by trapping cannot be reliably produced by eDNA. However,
the use of eDNA combined with local knowledge is an effective method for
observing crayfish populations. | en |
dc.format.extent | 32 | |
dc.format.mimetype | application/pdf | |
dc.language.iso | fin | |
dc.publisher | Jyväskylän yliopisto | |
dc.relation.ispartofseries | Jyväskylän yliopiston bio- ja ympäristötieteiden laitoksen tiedonantoja | |
dc.rights | In Copyright | |
dc.subject.other | eDNA | |
dc.subject.other | ympäristö-DNA | |
dc.title | Jokirapujen ja täplärapujen esiintymisen selvittäminen eDNA-menetelmällä | |
dc.type | book | |
dc.identifier.urn | URN:ISBN:978-951-39-8929-3 | |
dc.contributor.tiedekunta | Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta | fi |
dc.contributor.tiedekunta | Faculty of Sciences | en |
dc.contributor.tiedekunta | | fi |
dc.contributor.tiedekunta | Faculty of Sciences | en |
dc.contributor.laitos | Bio- ja ympäristötieteiden laitos | fi |
dc.contributor.laitos | Department of Biological and Environmental Science | en |
dc.contributor.laitos | | fi |
dc.contributor.laitos | Department of Biological and Environmental Science | en |
dc.type.coar | book | |
dc.relation.issn | 2669-8986 | |
dc.relation.numberinseries | 1 | |
dc.type.version | publishedVersion | |
dc.rights.copyright | © KIrjoittajat & Jyväskylän yliopisto, 2021 | |
dc.rights.accesslevel | openAccess | |
dc.subject.yso | täplärapu | |
dc.subject.yso | ravustus | |
dc.subject.yso | jokirapu | |
dc.format.content | fulltext | |
jyx.subject.uri | http://www.yso.fi/onto/yso/p5660 | |
jyx.subject.uri | http://www.yso.fi/onto/yso/p14906 | |
jyx.subject.uri | http://www.yso.fi/onto/yso/p5658 | |
dc.rights.url | https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/ | |