Multimodal Control of Bacterial Gene Expression by Red and Blue Light
Meier, S. S. M., Multamäki, E., Ranzani, A. T., Takala, H., & Möglich, A. (2024). Multimodal Control of Bacterial Gene Expression by Red and Blue Light. In J. C. Braman (Ed.), Synthetic Biology : Methods and Protocols (pp. 463-477). Humana Press. Methods in Molecular Biology, 2760. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-3658-9_26
Julkaistu sarjassa
Methods in Molecular BiologyTekijät
Toimittajat
Päivämäärä
2024Pääsyrajoitukset
Embargo päättyy: 2025-03-13Pyydä artikkeli tutkijalta
Tekijänoikeudet
© 2024 the Authors
By applying sensory photoreceptors, optogenetics realizes the light-dependent control of cellular events and state. Given reversibility, noninvasiveness, and exquisite spatiotemporal precision, optogenetic approaches enable innovative use cases in cell biology, synthetic biology, and biotechnology. In this chapter, we detail the implementation of the pREDusk, pREDawn, pCrepusculo, and pAurora optogenetic circuits for controlling bacterial gene expression by red and blue light, respectively. The protocols provided here guide the practical use and multiplexing of these circuits, thereby enabling graded protein production in bacteria at analytical and semi-preparative scales.
Julkaisija
Humana PressEmojulkaisun ISBN
978-1-0716-3657-2Kuuluu julkaisuun
Synthetic Biology : Methods and ProtocolsISSN Hae Julkaisufoorumista
1064-3745Asiasanat
Julkaisu tutkimustietojärjestelmässä
https://converis.jyu.fi/converis/portal/detail/Publication/207645181
Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedotKokoelmat
Rahoittaja(t)
Suomen AkatemiaRahoitusohjelmat(t)
Akatemiatutkija, SALisätietoja rahoituksesta
Financial support was provided by the European Commission (FET Open NEUROPA, grant 863214 to A.M.), the Deutsche Forschungsgemeinschaft (grant MO2192/4-2 to A.M), the Academy of Finland (grant 330678 to H.T.), a three-year grant from the University of Helsinki (to E.M and H.T.), the Finnish Cultural Foundation (grant 00220697 to E.M.), and a Bayreuth Humboldt Centre Senior Fellowship 2020 (to H.T.). ...Lisenssi
Samankaltainen aineisto
Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.
-
Optogenetic Control of Bacterial Expression by Red Light
Multamäki, Elina; García de Fuentes, Andrés; Sieryi, Oleksii; Bykov, Alexander; Gerken, Uwe; Ranzani, Américo Tavares; Köhler, Jürgen; Meglinski, Igor; Möglich, Andreas; Takala, Heikki (American Chemical Society (ACS), 2022)In optogenetics, as in nature, sensory photoreceptors serve to control cellular processes by light. Bacteriophytochrome (BphP) photoreceptors sense red and far-red light via a biliverdin chromophore and, in response, cycle ... -
Designing and testing red light-activated optogenetic tool for controlling gene expression in mammalian cells
Sutinen, Satu (2024)Optogenetiikka tutkii ja ohjaa soluja valoherkkien proteiinien, valoreseptorien avulla. Eräs valoreseptorityyppi on bakteerifytokromit, jotka aistivat punaista ja kaukopunaista valoa. Luonnossa bakteerifytokromit ovat usein ... -
The effects of photosensory module components for phytochrome activity and spectroscopy
Vanhatalo, Roosa (2023)Bakteerifytokromit voivat säädellä isäntäsolun sisäistä metaboliaa valo-olosuhteista riippuen. Tämän mahdollistaa se, että fytokromit voivat toimia osana kaksikomponenttijärjestelmiä, jotka voivat puolestaan säädellä geenien ... -
Comparative analysis of two paradigm bacteriophytochromes reveals opposite functionalities in two-component signaling
Multamäki, Elina; Nanekar, Rahul; Morozov, Dmitry; Lievonen, Topias; Golonka, David; Wahlgren, Weixiao Yuan; Stucki-Buchli, Brigitte; Rossi, Jari; Hytönen, Vesa P.; Westenhoff, Sebastian; Ihalainen, Janne A.; Möglich, Andreas; Takala, Heikki (Springer Science and Business Media LLC, 2021)Bacterial phytochrome photoreceptors usually belong to two-component signaling systems which transmit environmental stimuli to a response regulator through a histidine kinase domain. Phytochromes switch between red ... -
Leveraging the histidine kinase-phosphatase duality to sculpt two-component signaling
Meier, Stefanie S. M.; Multamäki, Elina; Ranzani, Américo T.; Takala, Heikki; Möglich, Andreas (Nature Publishing Group, 2024)Bacteria must constantly probe their environment for rapid adaptation, a crucial need most frequently served by two-component systems (TCS). As one component, sensor histidine kinases (SHK) control the phosphorylation of ...
Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.