Näytä suppeat kuvailutiedot

dc.contributor.advisorMarjomäki, Varpu
dc.contributor.advisorLindberg, Michael
dc.contributor.authorKantoluoto, Tino Ville Valtteri
dc.date.accessioned2020-12-03T09:39:14Z
dc.date.available2020-12-03T09:39:14Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/72949
dc.description.abstractEnterovirukset ovat pieniä ja vaipattomia positiivisen RNA genomin omaavia viruksia, jotka infektoivat pääasiassa ruoansulatuskanavan epiteelisoluja, mutta voivat muihin kudoksiin levitessään aiheuttaa erilaisia sairauksia. Echovirus 30 (E30) kuuluu enterovirusten B ryhmään ja aiheuttaa aivokalvontulehdus-epidemioita ympäri maailmaa. Huolimatta virulenttiudestaan, E30:n perusbiologiasta tiedetään toistaiseksi hyvin vähän. Tässä Pro Gradu -tutkielmassa puhdistettiin E30:tä ja tutkittiin sen soluun sisään menoa ja infektion alkupuolen tapahtumia. Osan enterovirus B -ryhmän jäsenten tiedetään käyttävän ”Decay accelerating factor” (DAF) -proteiinia sekä coxsackie- ja adenovirusreseptoria (CAR) soluun tunkeutuessaan. DAF:n on aiemmin osoitettu olevan tärkeä solun tekijä E30:n infektiossa. Tässä tutkielmassa osoitettiin radioaktiivisella reseptorisitoumis- kokeella että E30 sitoutuu DAF:iin, mutta ei lainkaan CAR:iin. Konfokaalimikroskopiakuvista tehdyt kolokalisaatioanalyysit osoittivat, että E30 ei käytä klatriinivälitteistä endosytoosireittiä, mutta siirtyy silti infektion edetessä aikaisiin ja myöhäisiin endosomeihin. Tyypillisesti enterovirus B ryhmän jäsenet eivät esiinny näissä solurakenteissa, lukuun ottamatta echovirus 7:ää (E7), joka myös on DAF:iin, mutta ei CAR:iin, sitoutuva enterovirus. E30-infektion osoitettiin myös etenevän nopeasti, sillä sen RNA-genomi alkoi replikoituimaan jo 2,5 tunnin jälkeen. Myös isäntäsolun solulimakalvostossa osoitettiin tapahtuvan muutoksia jo 2 tunnin jälkeen. Nämä tulokset tuovat tärkeää tietoa E30-infektion kulusta ja osoittavat samankaltaisuuksia E30:n ja E7:n välillä.fi
dc.description.abstractEnteroviruses are small, non-enveloped positive sense RNA viruses that primarily target the epithelial cells of the gastrointestinal tract, but are known to cause variety of clinical complications in secondary tissues. Echovirus 30 (E30) is a member of the enterovirus B genus and it causes epidemic bursts of aseptic meningitis all around the world. Despite being a common agent for this neurological disease, not much is known of E30 biology. Here, we have purified E30 and studied its cell entry and early infection using confocal microscopy and receptor binding assay. Some enterovirus B species are known to utilize decay accelerating factor (DAF) and coxsackie and adenovirus receptor (CAR) for cell entry and E30 has also previously been reported to use DAF for its infection. Here, we performed a receptor binding assay using radioactive E30 and showed that E30 indeed binds to DAF, but does not have any affinity towards CAR. Co-localization analyses performed from confocal images with various immunolabeled cell markers showed that E30 is not using the clathrin mediated pathway for its internalization, but still enters the early and late endosomes during infection. Localizing in these endosomal structures is not very common among members of enterovirus B species, apart from echovirus 7 (E7), which is another DAF-but-not-CAR binding virus. E30 showed rapid kinetics for its infection cycle, as genome replication was observed to start already after 2.5 h of infection. Modifications in the host cell endoplasmic reticulum were also observed already at 2 h p.i.. These findings of E30 early infection guide the following research to the right way and makes a connection between E30 and E7 behavior.en
dc.format.extent49
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isoen
dc.subject.otherCAR
dc.subject.otherDAF
dc.subject.otherpurification
dc.subject.otherendosome
dc.titleCell entry and early infection of Echovirus 30
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-202012036904
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.type.ontasotMaster’s thesisen
dc.contributor.tiedekuntaMatemaattis-luonnontieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sciencesen
dc.contributor.laitosBio- ja ympäristötieteiden laitosfi
dc.contributor.laitosDepartment of Biological and Environmental Scienceen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.oppiaineSolu- ja molekyylibiologiafi
dc.contributor.oppiaineCell and molecular biologyen
dc.rights.copyrightJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.rights.copyrightThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.type.publicationmasterThesis
dc.contributor.oppiainekoodi4013
dc.subject.ysovirukset
dc.subject.ysoinfektiot
dc.subject.ysoenterovirukset
dc.subject.ysosolut
dc.subject.ysoisäntäsolut
dc.subject.ysovirologia
dc.subject.ysoendosytoosi
dc.subject.ysoviruses
dc.subject.ysoinfections
dc.subject.ysoenteroviruses
dc.subject.ysocells
dc.subject.ysohost cells
dc.subject.ysovirology
dc.subject.ysoendocytosis
dc.format.contentfulltext
dc.type.okmG2


Aineistoon kuuluvat tiedostot

Thumbnail

Aineisto kuuluu seuraaviin kokoelmiin

Näytä suppeat kuvailutiedot