University of Jyväskylä | JYX Digital Repository

  • English  | Give feedback |
    • suomi
    • English
 
  • Login
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
View Item 
  • JYX
  • Opinnäytteet
  • Pro gradu -tutkielmat
  • View Item
JYX > Opinnäytteet > Pro gradu -tutkielmat > View Item

Endosomal ions and serum promote enterovirus uncoating

Thumbnail
View/Open
1.0Mb

Downloads:  
Show download detailsHide download details  
Authors
Haapakoski, Marjo
Date
2020
Discipline
Solu- ja molekyylibiologiaCell and molecular biology
Copyright
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.

 
Enterovirusten B ryhmään kuuluva Echovirus 1 on RNA-virus, jonka tiedetään infektoivan soluja ei-happamien endosomien välityksellä ja kerääntyvän neutraaleihin multivesikulaarisiin kappaleisiin. Tämän tutkimuksen alussa oli olemassa hyvin rajallisesti tietoa fysiologisista tekijöistä, jotka johtavat enterovirusten avautumiseen. Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää in vitro millainen yhdistelmä ioneja edistää echovirus 1:n avautumista fysiologisessa lämpötilassa. Päämääränä oli myös tutkia seerumin vaikutusta viruksen avautumiseen. Spektroskooppisissa mittauksissa käytettiin hyväksi SYBR Green II:n kykyä sitoutua viruksen RNA:han ja saada aikaan voimakasta fluoresenssia siinä tilanteessa, kun virus on avautunut vähän tai RNA on kokonaan vapautunut viruksen ulkopuolelle. Viruksen infektiivisyyttä erilaisten käsittelyjen jälkeen arvioitiin muun muassa sytopaattisen määrityksen avulla. Radioaktiivisesti leimatun viruksen avautumisen taso varmistettiin lopulta sakkaroosi- ja cesiumkloridigradienttierottelulla. Matala natriumpitoisuus yhdistettynä korkeaan kaliumpitoisuuteen edisti viruksen avautumista tämän tutkimuksen tulosten mukaan. Seerumilla havaittiin olevan myös viruspartikkelin avautumista ja genomin vapautumista edistävä vaikutus. Lisäksi tutkimuksessa tuli ilmi, että MgCl2 ja CaCl2 vakauttavat viruksen rakennetta. Tämä tutkimus paljasti uutta tietoa fysiologisista tekijöistä, jotka edistävät enterovirusten avautumista. Tutkimuksen tulosten pohjalta on mahdollista suunnitella uusia aihetta syventäviä jatkotutkimuksia. ...
 
Echovirus 1 (E1) belonging to the enterovirus B species is an RNA virus that enters non-acidic endosomes and accumulates in neutral multivesicular bodies. There was limited information about physiological triggers leading to uncoating of enteroviruses in the beginning of this study. The aim of this study was to evaluate in vitro what combinations of key ions promote uncoating of echovirus 1 at physiological temperature. Another aim of the study was to investigate the effect of serum on uncoating of the virus. Real-time fluorescence spectroscopy was used to measure the binding of SYBR Green II to viral RNA indicating the possible uncoating. End point dilution and cytopathic effect assay were performed to estimate viral infectivity after different treatments. Finally, sucrose and caesium chloride gradient separation of radioactively labeled virus was performed to confirm the state of uncoating. Low sodium concentration together with high potassium concentration induced the uncoating process according to our results. Addition of a small amount of serum enhanced the uncoating leading to the formation of the uncoating intermediate particle and genome egress. In addition, MgCl2 and CaCl2 prevented the uncoating process and, thus had a stabilizing effect in the assay. This study offered new information about molecular cues that trigger the uncoating under physiological conditions. Further studies can be designed based on these findings. ...
 
Keywords
viral uncoating a-particle echovirus 1 potassium RNA release sodium virukset enterovirukset infektiot seerumi ionit virologia viruses enteroviruses infections serum ions virology
URI

http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-202007025210

Metadata
Show full item record
Collections
  • Pro gradu -tutkielmat [23442]

Related items

Showing items with similar title or keywords.

  • Studying Factors that Contribute to Uncoating of Enteroviruses 

    Ruokolainen, Visa (2020)
    Enteroviruses are small, non-enveloped viruses with a positive sense single stranded RNA genome. They cause different diseases in humans, usually with symptoms of common cold, but also more severe acute and chronic infections ...
  • Development of novel probes for enterovirus B group to study uncoating and infection 

    Martikainen, Mari (University of Jyväskylä, 2016)
    Enterovirus B group (EV-B) viruses are important human pathogens which cause a variety of diseases from mild respiratory illnesses to more severe acute infections such as myocarditis and meningitis. EV-Bs have also ...
  • Cell entry and early infection of Echovirus 30 

    Kantoluoto, Tino Ville Valtteri (2020)
    Enterovirukset ovat pieniä ja vaipattomia positiivisen RNA genomin omaavia viruksia, jotka infektoivat pääasiassa ruoansulatuskanavan epiteelisoluja, mutta voivat muihin kudoksiin levitessään aiheuttaa erilaisia sairauksia. ...
  • The role of calpains in enterovirus infection 

    Kangasniemi, Niko (2019)
    Enterovirukset ovat viruspeitteettömien, positiivisten RNA-virusten ryhmään kuuluva virusperhe, jonka jäsenet aiheuttamat mitä monituisimpia tauteja suu- ja sorkkataudista aina aivokalvontulehdukseen. Aikaisemmat ...
  • Detecting Enterovirus Infection in Type 1 Diabetic Pancreas Tissue Using Immuno-Electron Microscopy 

    Lommi, Sara (2019)
    Tyypin 1 diabetes on krooninen autoimmuunisairaus, jossa kehon glukoositasapaino on häiriintynyt. Tautia sairastavan potilaan haiman beta-solut ovat tuhoutuneet, minkä takia insuliinia ei muodostu tarpeeksi kehon ...
  • Browse materials
  • Browse materials
  • Articles
  • Conferences and seminars
  • Electronic books
  • Historical maps
  • Journals
  • Tunes and musical notes
  • Photographs
  • Presentations and posters
  • Publication series
  • Research reports
  • Research data
  • Study materials
  • Theses

Browse

All of JYXCollection listBy Issue DateAuthorsSubjectsPublished inDepartmentDiscipline

My Account

Login

Statistics

View Usage Statistics
  • How to publish in JYX?
  • Self-archiving
  • Publish Your Thesis Online
  • Publishing Your Dissertation
  • Publication services

Open Science at the JYU
 
Data Protection Description

Accessibility Statement

Unless otherwise specified, publicly available JYX metadata (excluding abstracts) may be freely reused under the CC0 waiver.
Open Science Centre