dc.contributor.advisor | Marjomäki, Varpu | |
dc.contributor.advisor | Lindberg, Michael | |
dc.contributor.author | Kantoluoto, Tino Ville Valtteri | |
dc.date.accessioned | 2020-12-03T09:39:14Z | |
dc.date.available | 2020-12-03T09:39:14Z | |
dc.date.issued | 2020 | |
dc.identifier.uri | https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/72949 | |
dc.description.abstract | Enterovirukset ovat pieniä ja vaipattomia positiivisen RNA genomin omaavia viruksia, jotka infektoivat pääasiassa ruoansulatuskanavan epiteelisoluja, mutta voivat muihin kudoksiin levitessään aiheuttaa erilaisia sairauksia. Echovirus 30 (E30) kuuluu enterovirusten B ryhmään ja aiheuttaa aivokalvontulehdus-epidemioita ympäri maailmaa. Huolimatta virulenttiudestaan, E30:n perusbiologiasta tiedetään toistaiseksi hyvin vähän. Tässä Pro Gradu -tutkielmassa puhdistettiin E30:tä ja tutkittiin sen soluun sisään menoa ja infektion alkupuolen tapahtumia. Osan enterovirus B -ryhmän jäsenten tiedetään käyttävän ”Decay accelerating factor” (DAF) -proteiinia sekä coxsackie- ja adenovirusreseptoria (CAR) soluun tunkeutuessaan. DAF:n on aiemmin osoitettu olevan tärkeä solun tekijä E30:n infektiossa. Tässä tutkielmassa osoitettiin radioaktiivisella reseptorisitoumis- kokeella että E30 sitoutuu DAF:iin, mutta ei lainkaan CAR:iin. Konfokaalimikroskopiakuvista tehdyt kolokalisaatioanalyysit osoittivat, että E30 ei käytä klatriinivälitteistä endosytoosireittiä, mutta siirtyy silti infektion edetessä aikaisiin ja myöhäisiin endosomeihin. Tyypillisesti enterovirus B ryhmän jäsenet eivät esiinny näissä solurakenteissa, lukuun ottamatta echovirus 7:ää (E7), joka myös on DAF:iin, mutta ei CAR:iin, sitoutuva enterovirus. E30-infektion osoitettiin myös etenevän nopeasti, sillä sen RNA-genomi alkoi replikoituimaan jo 2,5 tunnin jälkeen. Myös isäntäsolun solulimakalvostossa osoitettiin tapahtuvan muutoksia jo 2 tunnin jälkeen. Nämä tulokset tuovat tärkeää tietoa E30-infektion kulusta ja osoittavat samankaltaisuuksia E30:n ja E7:n välillä. | fi |
dc.description.abstract | Enteroviruses are small, non-enveloped positive sense RNA viruses that primarily target the epithelial cells of the gastrointestinal tract, but are known to cause variety of clinical complications in secondary tissues. Echovirus 30 (E30) is a member of the enterovirus B genus and it causes epidemic bursts of aseptic meningitis all around the world. Despite being a common agent for this neurological disease, not much is known of E30 biology. Here, we have purified E30 and studied its cell entry and early infection using confocal microscopy and receptor binding assay. Some enterovirus B species are known to utilize decay accelerating factor (DAF) and coxsackie and adenovirus receptor (CAR) for cell entry and E30 has also previously been reported to use DAF for its infection. Here, we performed a receptor binding assay using radioactive E30 and showed that E30 indeed binds to DAF, but does not have any affinity towards CAR. Co-localization analyses performed from confocal images with various immunolabeled cell markers showed that E30 is not using the clathrin mediated pathway for its internalization, but still enters the early and late endosomes during infection. Localizing in these endosomal structures is not very common among members of enterovirus B species, apart from echovirus 7 (E7), which is another DAF-but-not-CAR binding virus. E30 showed rapid kinetics for its infection cycle, as genome replication was observed to start already after 2.5 h of infection. Modifications in the host cell endoplasmic reticulum were also observed already at 2 h p.i.. These findings of E30 early infection guide the following research to the right way and makes a connection between E30 and E7 behavior. | en |
dc.format.extent | 49 | |
dc.format.mimetype | application/pdf | |
dc.language.iso | en | |
dc.rights | In Copyright | en |
dc.subject.other | CAR | |
dc.subject.other | DAF | |
dc.subject.other | purification | |
dc.subject.other | endosome | |
dc.title | Cell entry and early infection of Echovirus 30 | |
dc.type | master thesis | |
dc.identifier.urn | URN:NBN:fi:jyu-202012036904 | |
dc.type.ontasot | Pro gradu -tutkielma | fi |
dc.type.ontasot | Master’s thesis | en |
dc.contributor.tiedekunta | Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta | fi |
dc.contributor.tiedekunta | Faculty of Sciences | en |
dc.contributor.laitos | Bio- ja ympäristötieteiden laitos | fi |
dc.contributor.laitos | Department of Biological and Environmental Science | en |
dc.contributor.yliopisto | Jyväskylän yliopisto | fi |
dc.contributor.yliopisto | University of Jyväskylä | en |
dc.contributor.oppiaine | Solu- ja molekyylibiologia | fi |
dc.contributor.oppiaine | Cell and molecular biology | en |
dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc | |
dc.type.publication | masterThesis | |
dc.contributor.oppiainekoodi | 4013 | |
dc.subject.yso | virukset | |
dc.subject.yso | infektiot | |
dc.subject.yso | enterovirukset | |
dc.subject.yso | solut | |
dc.subject.yso | isäntäsolut | |
dc.subject.yso | virologia | |
dc.subject.yso | endosytoosi | |
dc.subject.yso | viruses | |
dc.subject.yso | infections | |
dc.subject.yso | enteroviruses | |
dc.subject.yso | cells | |
dc.subject.yso | host cells | |
dc.subject.yso | virology | |
dc.subject.yso | endocytosis | |
dc.format.content | fulltext | |
dc.rights.url | https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/ | |
dc.type.okm | G2 | |