University of Jyväskylä | JYX Digital Repository

  • English  | Give feedback |
    • suomi
    • English
 
  • Login
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
View Item 
  • JYX
  • Opinnäytteet
  • Pro gradu -tutkielmat
  • View Item
JYX > Opinnäytteet > Pro gradu -tutkielmat > View Item

Uusia fosfodiesteraasi 10A-estäjiä virtuaalisen lääkeaineseulonnan avulla

Thumbnail
View/Open
1.6Mb

Downloads:  
Show download detailsHide download details  
Authors
Jokinen, Elmeri
Date
2018
Discipline
Solu- ja molekyylibiologiaCell and molecular biology
Copyright
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.

 
Virtuaaliseulonnassa uusia potentiaalisia lääkeaineita pyritään tunnistamaan hyödyntämällä tietoa sairauteen liittyvän proteiinin rakenteesta ja ligandeista. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli käyttää virtuaaliseulontaa uusien fosfodiesteraasi 10A (engl. phosphodiesterase 10A, PDE10A) – estäjien löytämiseksi. PDE10A toimii aivojen motorisia ja kognitiivisia toimintoja hallinnoivilla alueilla ja se on yhdistetty esimerkiksi skitsofrenian ja Huntingtonin taudin kehittymiseen. Työssä luotiin ligandin muodon ja elektrostaattiset ominaisuudet kuvaavia sitoutumismalleja sekä ligandipohjaisia, kvantitatiiviseen rakenne-aktiivisuussuhteeseen perustuvia malleja. Malleilla seulottiin n. 140 000 lääkkeenkaltaista molekyyliä sisältänyt tietokanta. Lupaavimpien molekyylien sitoutumiskonformaatioiden tarkempaan arviointiin käytettiin telakointia ja sitoutumisenergialaskentaa. Parhaan ennusteen saaneet molekyylit testattiin kokeellisesti ja näistä kolmelle määritettiin mikromolaarinen IC50-arvo. Uusien PDE10A-estäjien aktiivisuuden ennustettiin perustuvan erityisesti Q716- ja Y683-aminohappojen kanssa muodostuneisiin vetysidoksiin. Tutkimuksen tulokset tarjoavat lähtökohdan uusien PDE10A:han kohdistuvien lääkeainemolekyylien kehittämiseen. Luodut sitoutumisennusteet mahdollistavat löydettyjen estäjämolekyylien sitoutumisominaisuuksien parantamisen hyödyntämällä kattavammin PDE10A:n sitoutumistaskussa havaitut potentiaaliset vuorovaikutuskohdat. ...
 
In virtual screening, information about the structure and ligands of a disease-related protein is used to identify new potential drug candidates. The aim of this study was to utilize virtual screening to discover novel phosphodiesterase 10A (PDE10A) inhibitors. PDE10A operates in regions of brain related to motoric and cognitive functions and it has been linked to several diseases, such as schizophrenia and Huntington’s disease. In this study, models based on ligand shape and electrostatics and on ligand-based quantitative structure-acitivity relationship were created. The models were used to virtually screen a database of 140 000 drug-like molecules. Binding conformations of the most promising drug candidates were evaluated more precisely by using molecular docking and binding energy calculations. The best candidates were tested experimentally. Three new PDE10A inhibitors with micromolar IC50-values were discovered. Activity of the new inhibitors was predicted to be based especially on hydrogen bonding with the Q716 and Y683 residues in the PDE10A binding cavity. The results of this study provide a starting point for development of new potent drug molecules for PDE10A. The binding predictions created in this study enable improvement of the binding properties of the discovered inhibitors by a more comprehensive utilization of the potential interaction sites observed in the PDE10A binding cavity. ...
 
Keywords
rationaalinen lääkeainesuunnittelu skitsofrenia lääkesuunnittelu Huntingtonin tauti
URI

http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201809134099

Metadata
Show full item record
Collections
  • Pro gradu -tutkielmat [23381]

Related items

Showing items with similar title or keywords.

  • Virtuaalisen todellisuuden liikepahoinvoinnin vähentäminen eri liikkumiskyvyillä 

    Niskanen, Lauri (2020)
    Tässä tutkielmassa kartoitetaan virtuaalisen todellisuudessa tapahtuvan liikepahoinvoinnin vähentämisen keinoja eri liikkumiskykyjen näkökulmasta. Virtuaalinen todellisuus on kasvanut ilmiönä VR-laitteiston teknologian ...
  • Virtuaalisen tuen koettu arvo aktiivisessa oppimisessa 

    Kuntala, Jani-Petteri (2020)
    Maailman muuttuessa nopealla syklillä odotetaan myös ihmisten pysyvän muutoksen mukana. Jotta ihmiset pystyvät vastaamaan muutokseen, tulee ihmisten kehittää ja kouluttaa itseään aktiivisesti. Koulutusmarkkinat ovat Suomessa ...
  • Sosiaalisen tuen rakentuminen virtuaalisen painonhallintaohjelman keskustelupalstalla 

    Kastarinen, Riina (2020)
    Virtuaaliset painonhallintaohjelmat ovat yksi nykyajan ratkaisuista kasvavaan lihavuusongelmaan, jossa kaikkia lihavuushoitoa haluavia ei kyetä terveydenhuollon elintapaohjauksessa hoitamaan. Virtuaalisilla painonhallint ...
  • Kohti elokuvallista ajattelua : virtuaalisen todellisen ontologia Gilles Deleuzen ja Jean-Luc Godardin elokuvakäsityksissä 

    Oravala, Juha (Jyväskylän yliopisto, 2008)
    Juha Oravala tarkastelee tutkimuksessaan yhteyttä ranskalaisen filosofin Gilles Deleuzen (1925–1995) elokuvalle ominaisten liikkeen ja ajan kategorioille rakentuvan monijakoisen todellisuuskäsityksen sekä ranskalaisen ...
  • Uusien monoamiinioksidaasi B:n inhibiittorien hyödyntäminen lääkeainetutkimuksessa 

    Salmikangas, Sami; Roivas, Pekka (2018)
    Monoamiinioksidaasi (MAO) on entsyymi, jonka kahta eri alamuotoa (MAO-A ja MAO-B) esiintyy mitokondrioiden ulkokalvoilla. MAO-entsyymit katalysoivat monoamiinien, kuten dopamiinin, serotoniinin ja adrenaliinin, oksidatiivista ...
  • Browse materials
  • Browse materials
  • Articles
  • Conferences and seminars
  • Electronic books
  • Historical maps
  • Journals
  • Tunes and musical notes
  • Photographs
  • Presentations and posters
  • Publication series
  • Research reports
  • Research data
  • Study materials
  • Theses

Browse

All of JYXCollection listBy Issue DateAuthorsSubjectsPublished inDepartmentDiscipline

My Account

Login

Statistics

View Usage Statistics
  • How to publish in JYX?
  • Self-archiving
  • Publish Your Thesis Online
  • Publishing Your Dissertation
  • Publication services

Open Science at the JYU
 
Data Protection Description

Accessibility Statement

Unless otherwise specified, publicly available JYX metadata (excluding abstracts) may be freely reused under the CC0 waiver.
Open Science Centre