Show simple item record

dc.contributor.authorKairigo, Pius
dc.date.accessioned2024-10-03T11:31:04Z
dc.date.available2024-10-03T11:31:04Z
dc.date.issued2024
dc.identifier.isbn978-952-86-0334-4
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/97337
dc.description.abstractLääkeaineiden esiintyminen ympäristössä voi aiheuttaa ympäristölle ja terveydelle riskejä. Varsinkin antimikrobiset lääkeaineet voivat aiheuttaa resistenssin syntymistä ympäristössä jo terapeuttista annosta pienempinä pitoisuuksina. Tässä tutkimuksessa mitattiin valittujen antibioottien sekä antiretroviraalisten lääkeaineiden pitoisuuksia (MEC) urbaanissa hydrologisessa kierrossa Keniassa ja Sambiassa. Tutkittujen lääkeaineiden pitoisuus jätevedessä vaihteli välillä ˂0,1–956 μg l-1; jäteveden kiintoaineessa 0,1–82267 μg kg-1 ja sedimenttinäytteissä 4125 μg kg-1. Jäteveden sisältämä kiintoaine on siis merkittävä reitti ympäristöön. Sambian Lusakasta kerätyistä ympäristönäytteistä analysoitiin 33 kliinisesti tärkeän antibioottiresistentin geenin ja kahden resistenssigeenien liikkumiseen liittyvän integronin (intl1_1 ja intl1_2) profiilieja. Resistenssigeenejä, jotka antavat vastustuskyvyn sulfonamideja, trimetopriimiä, tetrasykliiniä, kinoloneja, makrolideja, rifamysiiniä ja β-laktaameja (mukaan lukien karbapeneemit) vastaan esiintyi näytteissä runsaasti. Niiden suhteellinen esiintyvyys vaihteli 10–3–10–1 kopiota 16S rRNA -geeniä kohti. β-laktamaasigeeni, blaTEM, oli suhteellisesti useimmin esiintyvä resistenssigeeni (10–2, tarkoittaen 1 geenikopiota 100 bakteeria kohti) sakokaivolietteen käsittelyaltaan sedimentissä ja Manchinchin jäteveden puhdistamolle tulevassa jätevedessä, kun taas vesinäytteissä suhteellinen antibioottiresistenttien geenien runsaus oli kymmenesosa tuosta määrästä (10–3). Antibioottien ja niille resistenttien geenien runsas esiintyminen ja päätyminen pintavesiin lisää riskiä alajuoksun ympäristöille sekä saastuneelle pintavedelle altistuville eläimille ja ihmisille. Normaaliin virtsaan lisätyt tutkittavat lääkeaineet poistuivat puusta ja turpeesta valmistetun jauhemaisen aktiivihiilikäsittelyn avulla tehokkaasti, kokonaispoistuma oli yli 93 %. Lääkeaineiden adsorptiokapasiteetti todellisessa virtsamatriisissa oli 0,75–16,6 mg g-1 verrattuna puhtaaseen veteen 10–200 mg g-1. Tämä johtuu siitä, että virtsassa kilpailevan matriisin pitoisuus on useita kertaluokkia suurempi kuin lääkeaineilla. Silti lääkeaineiden poisto aktiivihiilen absorboitumalla tarjoaa mahdollisuuden kehittää yksinkertaisia ja edullisia käsittelymenetelmiä lääkeaineiden poistamiseen erilliskerätystä virtsasta.fin
dc.description.abstractPresence of active pharmaceutical ingredients (APIs) in the environment below therapeutic doses is accessory to driving resistance selection in micro-organisms. This study evaluated the measured environmental concentrations (MEC) of selected antimicrobials and antibiotic resistance genes in selected urban hydrological cycles in Kenya and Zambia. The MEC for selected APIs in aqueous, suspended particulate matter (SPM), and sediment samples ranged between ˂ 0.1 to 956 μg l-1; ˂ 0.1 to 82267 μg kg-1; < 0.1 to 4125 μg kg-1, respectively. Emission of some APIs was through the SPM phase which shows that SPM is an important phase for investigation. Profiles of 33 clinically important antibiotic resistant genes (ARGs) and 2 integrons (intl1_1 and intl1_2) were analyzed from samples collected in Lusaka Zambia. ARGs against sulfonamides, trimethoprim, tetracycline, quinolones, macrolides, rifamycin and β- lactams (including carbapenems), showed the highest average relative gene abundance of 10-3 to 10-1 genes per 16S rRNA gene. The β-lactamase gene blaTEM had the highest relative abundance (10-2, indicating 1 gene copy per 100 bacteria) in sediment samples fecal sludge and in Manchinchi WWTP influent water, whereas in water samples the relative abundance was one log lower (10-3). Widespread detection of antibiotics and ARGs in surface water poses increased risk for downstream environments, as well as animals and humans who are exposed to contaminated surface water. Removal of model API from real urine by adsorption using wood and peat based powdered activated carbon (AC) showed overall removal > 93 %. The adsorption capacity of the AC in urine and pure water ranged between 0.75–16.6 mg g-1 and 10–200 mg g-1 respectively. This could be attributed to the urine matrix effects. Removal of APIs by AC offers possibility to further develop simple, robust, and sustainable treatment technologies for point-of-source mass reduction method.eng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isoeng
dc.publisherJyväskylän yliopisto
dc.relation.ispartofseriesJYU Dissertations
dc.relation.haspart<b>Artikkeli I:</b> Kairigo, P., Ngumba, E., Sundberg, L.-R., Gachanja, A., & Tuhkanen, T. (2020). Occurrence of antibiotics and risk of antibiotic resistance evolution in selected Kenyan wastewaters, surface waters and sediments. <i>Science of the Total Environment, 720, Article 137580.</i> DOI: <a href="https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.137580"target="_blank">10.1016/j.scitotenv.2020.137580</a>. JYX: <a href="https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/69194"target="_blank"> jyx.jyu.fi/handle/123456789/69194</a>
dc.relation.haspart<b>Artikkeli II:</b> Kairigo, P., Ngumba, E., Sundberg, L.-R., Gachanja, A., & Tuhkanen, T. (2020). Contamination of Surface Water and River Sediments by Antibiotic and Antiretroviral Drug Cocktails in Low and Middle-Income Countries : Occurrence, Risk and Mitigation Strategies. <i>Water, 12(5), Article 1376.</i> DOI: <a href="https://doi.org/10.3390/w12051376"target="_blank">10.3390/w12051376</a>
dc.relation.haspart<b>Artikkeli III:</b> Kairigo P., Laukkanen P., Ngumba. E, Nyirenda J., Kasoma N., Gachanja A., Tuhkanen T. & Sundberg L.-R. (2024). Presence of antibiotics and antibiotic resistant genes in urban hydrological cycles of Lusaka, Zambia using high- throughput quantitative PCR analysis. <i>Manuscript.</i>
dc.relation.haspart<b>Artikkeli IV:</b> Kairigo P., Ilomäki J., Ngumba E., Ouma J., Otieno A., Madivoli E., Gachanja A. & Tuhkanen T. (2024). Removal of antibiotics and antiretroviral drugs from hydrolyzed urine using activated carbon. <i>Submitted Manuscript.</i>
dc.rightsIn Copyright
dc.titleOccurrence and Fate of Antimicrobials and Antibiotic Resistance Genes in Urban Hydrological Cycles
dc.typedoctoral thesis
dc.identifier.urnURN:ISBN:978-952-86-0334-4
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Mathematics and Scienceen
dc.contributor.tiedekuntaMatemaattis-luonnontieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06
dc.relation.issn2489-9003
dc.rights.copyright© The Author & University of Jyväskylä
dc.rights.accesslevelopenAccess
dc.type.publicationdoctoralThesis
dc.format.contentfulltext
dc.rights.urlhttps://rightsstatements.org/page/InC/1.0/


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

In Copyright
Except where otherwise noted, this item's license is described as In Copyright