Show simple item record

dc.contributor.advisorAhtiainen, Maarit
dc.contributor.advisorKuopio, Teijo
dc.contributor.authorSirkiä, Onni
dc.date.accessioned2022-06-22T08:54:04Z
dc.date.available2022-06-22T08:54:04Z
dc.date.issued2022
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/81952
dc.description.abstractKolorektaalisyöpä on maailmanlaajuisesti yksi yleisimmistä ja kuolettavimmista syövistä. Immuunisolujen rooli sen kehityksessä on tunnettu jo pitkään. Korkea sytotoksisten T-solujen tiheys primäärikasvaimessa on yhdistetty parempaan kolorektaalisyövän ennusteeseen, mutta B-solulinjan ennustemerkitys tunnetaan huonommin. Tämän tutkielman tarkoitus oli kartoittaa B-solujen ja plasmasolujen eri alatyyppien esiintymistä kolorektaalisyöpäkasvaimissa sekä arvioida niiden ennustemerkitystä. Kudosmikrosirunäytteet 912 primäärikasvaimesta immuno-värjättiin B-solujen ja plasmasolujen eri alatyyppien solumerkkiaineilla multiplex-immunohistokemian avulla. QuPath-ohjelmalla tehdyn koneoppimispohjaisen kuva-analyysin tulosten perusteella näytteistä havaitut B- ja plasmasolut jaettiin alatyypeikseen, ja kasvainten solutiheydet laskettiin erikseen kullekin alatyypille. Eri alatyyppien ennustemerkityksiä tarkasteltiin sekä Kaplan-Meierin menetelmän että Coxin regressioiden avulla. Tulosten perusteella korkea plasmasolutiheys on yhteydessä parempaan kolorektaalisyövän ennusteeseen solujen alatyypistä sekä muista tekijöistä riippumatta. Havainto on ristiriidassa IgG1+ plasmasolujen hypotisoidun paremman ennustemerkityksen kanssa. B-muistisolujen ja antigeeniä esittelevien B-solujen korkea tiheys invaasiorintaman näytteissä oli yhteydessä parempaan ennusteeseen, kun taas kasvaimen keskiosan näytteissä merkittävin ennustetekijä B-solujen osalta oli korkea naiivien B-solujen solutiheys. B-solujen ennustemerkitys oli kuitenkin riippuvainen muista tekijöistä, mikä viittaa niiden toimivan yhteistyössä todennäköisesti sytotoksisten T-lymfosyyttien kanssa.fi
dc.description.abstractColorectal cancer is one of the most common and deadly cancers worldwide. The significance of immune cells in colorectal tumor development is well recognized. High density of cytotoxic T cells in colorectal tumors has been associated with a better prognosis, but the prognostic importance of B lymphocyte lineage is less well understood. The aim of this study was to assess the presence of different B cell and plasma cell subsets in colorectal tumors and evaluate their prognostic importance. Tissue microarray samples from 912 primary colorectal tumors were stained with antibodies against different B cell and plasma cell markers by using multiplex immunohistochemistry. Images of the immunostained tumor tissue samples were analyzed with machine learning-based image analysis software QuPath. Detected cells were phenotyped based on the intensity of different surface markers, and cell densities were calculated for all the observed subsets. The prognostic importance of different plasma cell and B cell subsets was assessed using Kaplan-Meier estimators and Cox regression analyses. High plasma cell density had independent association with better survival regardless of the subset, thus contradicting the hypothesized superior prognostic potential of IgG1+ plasma cells. High densities of memory and antigen-presenting B cells were associated with better survival in the invasive margin, whereas high density of naïve B cells showed association with improved survival in the tumor center. However, the prognostic importance of B cells was not independent, suggesting that they may cooperate with cytotoxic T lymphocytes.en
dc.format.extent78
dc.language.isoen
dc.subject.otherhumoral immunity
dc.subject.othertumor microenvironment
dc.titleThe Prognostic Importance of B Cells and Plasma Cells in Colorectal Cancer
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-202206223557
dc.type.ontasotMaster’s thesisen
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.contributor.tiedekuntaMatemaattis-luonnontieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sciencesen
dc.contributor.laitosBio- ja ympäristötieteiden laitosfi
dc.contributor.laitosDepartment of Biological and Environmental Scienceen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.oppiaineSolu- ja molekyylibiologiafi
dc.contributor.oppiaineCell and molecular biologyen
dc.rights.copyrightJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.rights.copyrightThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.contributor.oppiainekoodi4013
dc.subject.ysosolubiologia
dc.subject.ysoimmunohistokemia
dc.subject.ysolymfosyytit
dc.subject.ysocell biology
dc.subject.ysoimmunohistochemistry
dc.subject.ysolymphocytes
dc.rights.accessrightsTekijä ei ole antanut lupaa avoimeen julkaisuun, joten aineisto on luettavissa vain Jyväskylän yliopiston kirjaston arkistotyösemalta. Ks. https://kirjasto.jyu.fi/kokoelmat/arkistotyoasema..fi
dc.rights.accessrightsThe author has not given permission to make the work publicly available electronically. Therefore the material can be read only at the archival workstation at Jyväskylä University Library (https://kirjasto.jyu.fi/collections/archival-workstation).en


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record