ROS1 gene rearrangements in non-small cell lung cancer : immunohistochemistry and fluorescence in situ hybridization
Tekijät
Päivämäärä
2020Pääsyrajoitukset
Tekijä ei ole antanut lupaa avoimeen julkaisuun, joten aineisto on luettavissa vain Jyväskylän yliopiston kirjaston arkistotyösemalta. Ks. https://kirjasto.jyu.fi/kokoelmat/arkistotyoasema..
Tekijänoikeudet
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
Keuhkosyöpä on maailman yleisin syöpäkuolemien aiheuttaja. Histologisesti se jaetaan pienisoluiseen (15 %) ja ei-pienisoluiseen (85 %) keuhkosyöpään (engl. non-small cell lung cancer, NSCLC). ROS1-geenin uudelleenjärjestäytymät ovat harvinaisia NSCLC:ssä (1–2 %), mutta tärkeitä tunnistaa kohdennettua hoitoa varten. Immunohistokemia (IHK) ja fluoresenssi in situ hybridisaatio (FISH) ovat yleisiä menetelmiä tutkittaessa ROS1-uudelleenjärjestäytymiä. Potilaat, joilla ei ole ROS1-uudelleenjärjestäytymiä, voidaan sulkea pois IHK-seulonnalla. FISH:ta tarvitaan positiivisten IHK-tulosten varmistuksessa. Tavoitteena oli selvittää ROS1-uudelleenjärjestäytymien esiintyvyys suomalaisessa NSCLC-aineistossa ja verrata IHK:aa ja FISH:ta ROS1-analytiikassa. Monikudosblokit koostuivat 578 leikattujen potilaiden kasvainnäytteistä (319 adenokarsinoomaa, 235 levyepiteelikarsinoomaa, 24 tarkemmin määrittelemätöntä NSCLC:ää), jotka saatiin kahdesta suomalaisesta biopankista. Formaliinilla fiksoidut ja parafiiniin valetut leikkeet värjättiin ROS1-vasta-aineella. IHK:n tulos oli negatiivinen 548 (94,81 %), positiivinen kahdessa näytteessä (0,35 %) ja epäselvä 28 (4,84 %) näytteessä. Positiiviset IHK-tulokset olivat positiivisia FISH:ssa tai toisen sukupolven sekvensoinnissa ja epäselvät IHK-tulokset olivat negatiivisia FISH:ssa. ROS1-uudelleenjärjestäytymien esiintyvyys oli odotettua pienempi (0,35 %, adenokarsinoomissa 0,63). ROS1-IHK:n herkkyys (100 %) ja tarkkuus (96 %) vastasivat hyvin aiempia tuloksia. Vain
muutamat IHK-näytteet näyttävät tarvitsevan FISH-varmistuksen.
...
Lung cancer is the leading cause of cancer death worldwide. Histologically, it is divided into small cell (15 %) and non-small cell (85 %) lung cancer (NSCLC). Rearrangements of ROS1 gene are rare (1–2 % of NSCLC), but essential to recognize for targeted therapy. Two common methods to examine ROS1 rearrangements are immunohistochemistry (IHC) and fluorescence in situ hybridization (FISH). The patients without ROS1 rearrangements can be ruled out by IHC screening. FISH is needed to confirm positive IHC results. This study aimed to examine the prevalence of ROS1 rearrangements among a Finnish NSCLC material and to compare IHC and FISH in ROS1 analysis. Tissue microarrays of 578 samples (319 adenocarcinomas, 235 squamous cell carcinomas and 24 NSCLC-not otherwise specified) were obtained from two Finnish
biobanks. Only surgically operated patients were included in the material. Formalin fixed and paraffin embedded sections were stained using a ROS1 antibody. IHC was negative in 548 (94.81 %), positive in 2 (0.35 %) and equivocal in 28 (4.84 %) samples. The IHC positive samples were positive in FISH or NGS and equivocal samples were negative in FISH. The prevalence of ROS1 rearrangements was 0.35 % (0.63 % among adenocarcinomas) being less
than expected. The sensitivity and specificity of ROS1 IHC were 100 % and 96 % corresponding well with previous results. Only few IHC samples seems to need FISH confirmation.
...
Asiasanat
molecular diagnostics tyrosine kinase translokaatio syöpätaudit keuhkosyöpä geenit adenokarsinooma syöpäsolut okasolusyöpä immunohistokemia histologia translocation (genetics) cancerous diseases pulmonary cancer genes adenocarcinoma cancer cells squamous cell carcinoma immunohistochemistry histology
Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedotKokoelmat
- Pro gradu -tutkielmat [28143]
Samankaltainen aineisto
Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.
-
The expression and prognostic relevance of programmed cell death protein 1 in tongue squamous cell carcinoma
Tervo, Sanni; Seppälä, Miia; Rautiainen, Markus; Huhtala, Heini; Salo, Tuula; Al‐Samadi, Ahmed; Kuopio, Teijo; Ahtiainen, Maarit; Tommola, Satu; Paavonen, Timo; Toppila‐Salmi, Sanna (Wiley-Blackwell, 2020)Background Programmed cell death protein 1 (PD‐1) is an immune checkpoint receptor which plays an important role in a patient´s immune responses to microbial and cancer antigens. It is expressed in tumor infiltrating ... -
The Value of Liquid Biopsies for Guiding Therapy Decisions in Non-small Cell Lung Cancer
Saarenheimo, Jatta; Eigeliene, Natalja; Andersen, Heidi; Tiirola, Marja; Jekunen, Antti (Frontiers Media SA, 2019)Targeted therapies have allowed for an individualized treatment approach in non-small-cell lung cancer (NSCLC). The initial therapeutic decisions and success of targeted therapy depend on genetic identification of personal ... -
Quantitative multiplexed analysis of indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO) and arginase-1 (ARG1) expression and myeloid cell infiltration in colorectal cancer
Elomaa, Hanna; Härkönen, Jouni; Väyrynen, Sara A.; Ahtiainen, Maarit; Ogino, Shuji; Nowak, Jonathan A.; Lau, Mai Chan; Helminen, Olli; Wirta, Erkki-Ville; Seppälä, Toni T.; Böhm, Jan; Mecklin, Jukka-Pekka; Kuopio, Teijo; Väyrynen, Juha P. (Elsevier, 2024)Indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) are amino acid metabolizing enzymes frequently highly expressed in cancer. Their expression may deplete essential amino acids, lead to immunosuppression, and promote ... -
New spiro-indeno[1,2-b]quinoxalines clubbed with benzimidazole scaffold as CDK2 inhibitors for halting non-small cell lung cancer; stereoselective synthesis, molecular dynamics and structural insights
Barakat, Assem; Alshahrani, Saeed; Al-Majid, Abdullah Mohammed; Alamary, Abdullah Saleh; Haukka, Matti; Abu-Serie Marwa, M.; Domingo, Luis R.; Ashraf, Sajda; Ul-Haq, Zaheer; Nafie, Mohamed S.; Teleb, Mohamed (Informa Healthcare, 2023)Despite the crucial role of CDK2 in tumorigenesis, few inhibitors reached clinical trials for managing lung cancer, the leading cause of cancer death. Herein, we report combinatorial stereoselective synthesis of rationally ... -
MIHIC: a multiplex IHC histopathological image classification dataset for lung cancer immune microenvironment quantification
Wang, Ranran; Qiu, Yusong; Wang, Tong; Wang, Mingkang; Jin, Shan; Cong, Fengyu; Zhang, Yong; Xu, Hongming (Frontiers Media, 2024)Background: Immunohistochemistry (IHC) is a widely used laboratory technique for cancer diagnosis, which selectively binds specific antibodies to target proteins in tissue samples and then makes the bound proteins visible ...
Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.