Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
Authors
Date
2019Copyright
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Tutkielman kirjallisessa osassa perehdytään bakteerin soluseinän biosynteesin, peptidoglykaanin hajottamiseen, puhdistamiseen sekä karakterisointiin. Kokeellisessa osassa valmistettiin kahta lähtöainetta, joita voidaan käyttää lysostafiinientsyymin siirtymätila-analogin valmistamisessa. Valmistetutut komponentit olivat suojattu aminometyylihypofosforihapoke sekä N-akryloyyliglysinaatti.
Peptidoglykaanin biosynteesiä käydään läpi aloittaen sytoplasmassa tapahtuvista reaktioista siirtyen aikajanalla eteenpäin solukalvon sisäreunalla ja sen ulkopuolella tapahtuviin reaktioihin. Kussakin vaiheessa käydään läpi reaktioita mahdollistavat entsyymit. Biosynteesin tarkastelu päätetään ristisiltoja muodostavien entsyymien toimintaan. Peptidoglykaanin hajottamisesta käydään läpi niin autolysiinien kuin antibioottienkin toiminta. Useat antibiootit estävätkin juuri biosynteesissä vaikuttavien entsyymien toimintaan.
Peptidoglykaanin tutkimuksesta perehdytään peptidoglykaanin eristämiseen ja puhdistukseen, sekä erilaisiin menetelmiin, joita käyttäen voidaan karakterisoida sen rakennetta. Usein peptidoglykaani erotetaan muista soluseinän osista ja hajotetaan liukenevaan muotoon. On myös olemassa analyysimenetelmiä, joilla voidaan tutkia liukenematonta peptidoglykaania. Erikokoisia peptidoglykaanifragmentteja on myös mahdollista valmistaa.
Peptidoglykaanin rakenteen ja siihen vaikuttavien entsyymien tutkiminen on tärkeää sillä, ne ovat potentiaalisia kohteita esimerkiksi uusille antibiooteille. Entsyymejä voidaan tutkia siirtymätila-analogien avulla. Ymmärtämällä entsyymien toimintamekanismeja on mahdollista kehittää parempia inhibiittoreita tai uusia entsyymien kaltaisia molekyylejä, jotka voivat katalysoida haluttuja reaktiota.
...


Keywords
Metadata
Show full item recordCollections
- Pro gradu -tutkielmat [25543]
Related items
Showing items with similar title or keywords.
-
Peptidoglykaanihydrolaasin siirtymätila-analogin synteesi
Kankkunen, Eveliina (2023)Tutkielmassa tutustutaan bakteerien rakenteeseen ja niiden kasvuun ja hajoamiseen vaikuttaviin tekijöihin. Aluksi perehdytään peptidoglykaanin rakenteeseen ja synteesiin, minkä jälkeen käsitellään peptidoglykaania hajottavia ... -
Degradation of Antibiotic Vancomycin by UV Photolysis and Pulsed Corona Discharge Combined with Extrinsic Oxidants
Nikitin, Dmitri; Kaur, Balpreet; Preis, Sergei; Dulova, Niina (MDPI AG, 2023)Antibiotics are the most frequently detected pharmaceuticals in the environment creating conditions for the development of resistant genes in bacteria. Degradation and mineralization of glycopeptide antibiotic vancomycin ... -
A Plastic Biosynthetic Pathway for the Production of Structurally Distinct Microbial Sunscreens
Arsın, Sıla; Delbaje, Endrews; Jokela, Jouni; Wahlsten, Matti; Farrar, Zoë M.; Permi, Perttu; Fewer, David (American Chemical Society (ACS), 2023)Mycosporine-like amino acids (MAAs) are small, colorless, and water-soluble secondary metabolites. They have high molar extinction coefficients and a unique UV radiation absorption mechanism that make them effective ... -
Beta-Lactam Sensitive Bacteria Can Acquire ESBL-Resistance via Conjugation after Long-Term Exposure to Lethal Antibiotic Concentration
Ruotsalainen, Pilvi; Given, Cindy; Penttinen, Reetta; Jalasvuori, Matti (MDPI, 2020)Beta-lactams are commonly used antibiotics that prevent cell-wall biosynthesis. Beta-lactam sensitive bacteria can acquire conjugative resistance elements and hence become resistant even after being exposed to lethal (above ... -
Klebsiella pneumoniae -bakteerilajia infektoivien faagien eristys ja faagiresistenssimekanismien kartoittaminen
Thind, Navjot (2021)Antibioottivastustuskykyisten Klebsiella pneumoniae -bakteerikantojen aiheuttamat infektiot ovat globaalisti kasvava ongelma, sillä ne saattavat olla resistenttejä kaikille kliinisessä käytössä oleville antibiooteille. ...