Peptidoglykaanihydrolaasin siirtymätila-analogin synteesi
Tutkielmassa tutustutaan bakteerien rakenteeseen ja niiden kasvuun ja hajoamiseen vaikuttaviin tekijöihin. Aluksi perehdytään peptidoglykaanin rakenteeseen ja synteesiin, minkä jälkeen käsitellään peptidoglykaania hajottavia entsyymejä eli peptidoglykaanihydrolaaseja ja antibiootteja. Lopuksi tutustutaan siirtymätila-analogeihin, niiden suunnitteluun ja käyttömahdollisuuksiin. Siirtymätila-analogien avulla voidaan tutkia entsyymien reaktiomekanismeja ja substraatin sitoutumiseen osallistuvia aminohappoja. Lisäksi niiden pohjalta on onnistuttu kehittämään inhibiittoreita erilaisille entsyymeille, ja tulevaisuudessa mahdollisesti uusia antibiootteja.
Kokeellisessa osassa tarkoituksena oli valmistaa siirtymätila-analogi lysostafiini entsyymin substraatin sitoutumistutkimuksia varten. Työssä käytettiin lähtöaineina kahta aiemmin valmistettua yhdistettä. Synteesi ei kuitenkaan onnistunut, vaan suurimmaksi osaksi reaktiokolvista löytyi liuottimena käytettyä N-metyylimorfoliinia ja mahdollisesti sen suolaa N metyylimorfolinium kloridia.
...
Keywords
Metadata
Show full item recordCollections
- Pro gradu -tutkielmat [29041]
License
Related items
Showing items with similar title or keywords.
-
Peptidoglykaanin hajottaminen, puhdistus ja karakterisointi
Ojala, Alexandra (2019)Tutkielman kirjallisessa osassa perehdytään bakteerin soluseinän biosynteesin, peptidoglykaanin hajottamiseen, puhdistamiseen sekä karakterisointiin. Kokeellisessa osassa valmistettiin kahta lähtöainetta, joita voidaan ... -
Glyoxalase-based toolbox for the enantioselective synthesis of α-hydroxy carboxylic acids
Yedigenov, Mussa; Amire, Niyaz; Abdirassil, Aizat; Mulikova, Tomiris; Begenov, Azamat; Kiesilä, Anniina; Peshkov, Anatoly A.; Peshkov, Vsevolod A.; Utepbergenov, Darkhan (Royal Society of Chemistry, 2024)We report highly enantioselective synthesis of L-α-hydroxy carboxylic acids (L-αHCAs) via enzymatic intramolecular Cannizzaro reaction of (hetero)aryl glyoxals in the presence of glutathione-independent human glyoxalase ... -
Chemical shift assignments of the catalytic domain of Staphylococcus aureus LytM
Tossavainen, Helena; Pitkänen, Ilona; Antenucci, Lina; Thapa, Chandan; Permi, Perttu (Springer, 2023)S. aureus resistance to antibiotics has increased rapidly. MRSA strains can simultaneously be resistant to many different classes of antibiotics, including the so-called “last-resort” drugs. Resistance complicates treatment, ... -
Beta-Lactam Sensitive Bacteria Can Acquire ESBL-Resistance via Conjugation after Long-Term Exposure to Lethal Antibiotic Concentration
Ruotsalainen, Pilvi; Given, Cindy; Penttinen, Reetta; Jalasvuori, Matti (MDPI, 2020)Beta-lactams are commonly used antibiotics that prevent cell-wall biosynthesis. Beta-lactam sensitive bacteria can acquire conjugative resistance elements and hence become resistant even after being exposed to lethal (above ... -
Klebsiella pneumoniae -bakteerilajia infektoivien faagien eristys ja faagiresistenssimekanismien kartoittaminen
Thind, Navjot (2021)Antibioottivastustuskykyisten Klebsiella pneumoniae -bakteerikantojen aiheuttamat infektiot ovat globaalisti kasvava ongelma, sillä ne saattavat olla resistenttejä kaikille kliinisessä käytössä oleville antibiooteille. ...