Näytä suppeat kuvailutiedot

dc.contributor.advisorVihinen-Ranta, Maija
dc.contributor.authorHakanen, Satu
dc.date.accessioned2018-01-03T08:38:38Z
dc.date.available2018-01-03T08:38:38Z
dc.date.issued2017
dc.identifier.otheroai:jykdok.linneanet.fi:1809781
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/56574
dc.description.abstractHerpes simplex virus 1 (HSV-1) on alfaherpesviruksiin kuuluva vaipallinen, kaksijuosteista DNA:ta sisältävä virus. Kosketus- ja pisaratartuntana herkästi leviävä HSV-1 on maailmanlaajuisesti huomattava taudinaiheuttaja, sillä virusta kantaa arviolta 67 % väestöstä. Tartunta on elinikäinen. Latentissa vaiheessa HSV-1:n genomi säilyy aistihermojen hermosolmukkeissa. Viruksen aktivoituminen lyyttiseen lisääntymiskiertoon oireilee tyypillisesti rakkuloina kasvojen iholla ja limakalvoilla. HSV-1:n genomin replikoituminen ja uusien viruskapsidien muodostuminen tapahtuvat isäntäsolun tumassa, jossa viruksen rakentumisalue laajenee infektion edetessä. Samalla isäntäsolun kromatiini tiivistyy ja pakkautuu tuman reunamille. Uudet viruskapsidit poistuvat tumasta kuroutumalla tumakalvon läpi mekanismilla, joka tunnetaan jo varsin hyvin. Sen sijaan on vielä epäselvää, kuinka kapsidit saavuttavat sisemmän tumakalvon liikkuessaan kromatiinin seassa. Tässä tutkimuksessa määritettiin isäntäsolun kromatiinin ominaisuuksia ja vuorovaikutuksia viruksen kanssa lyyttisen HSV-1-infektion myöhäisessä vaiheessa. Löyhästi pakkautuneen aktiivisen eukromatiinin ja tiiviimmin pakkautuneen hiljaisen heterokromatiinin erottamiseen käytettiin vasta-ainemarkkereita, jotka sitoutuvat kromatiinin eri muodoille ominaisiin histonimodifikaatioihin. Konfokaali- ja elektronimikrokooppikuvauksen perusteella infektoituneen solun kromatiini oli tiivistynyt tuman reunoille epäsäännöllisen muotoiseksi renkaaksi. Tiivistynyttä kromatiinirengasta katkoivat paikoitellen sisemmälle tumakalvolle ulottuvat aukkokohdat, joiden kautta viruskapsidien nähtiin päätyvän tumakalvon läheisyyteen. Tiheämmän kromatiinin sekaan sijoittuneiden viruskapsidien ympärillä nähtiin elektronimikroskooppikuvauksessa usein sädekehän kaltainen tyhjä tila, joka voisi selittyä kapsidin ja kromatiinin välisillä vuorovaikutuksilla. Kromatiinin eri muotojen sijoittuminen muuttui infektiossa siten, että eukromatiinia havaittiin tumakalvon vieressä ns. periferaalisella alueella. Periferaalinen eukromatiini saattaa viitata viruksen aikaansaamiin muutoksiin geenitoiminnassa. Lyyttisellä HSV-1-infektiolla on merkittävä vaikutus isäntäsolun tumaan ja kromatiinin rakenteeseen. Kromatiinin ja viruksen välisten vuorovaikutusten tarkempi määrittäminen voi tuoda lisätietoa kapsidien tumansisäisistä vaiheista ja tarjota samalla potentiaalisia kohteita lääkemolekyyleille, joilla infektion eteneminen pyritään pysäyttämään tumaan.fi
dc.description.abstractHerpes simplex virus 1 (HSV-1) is an enveloped icosahedral dsDNA virus, and a common human pathogen with an estimated incidence of 67% in the global population. Infected individuals permanently carry the latent HSV-1 in neuronal cells. Sporadic virus reactivation into the lytic life cycle typically manifests as facial lesions known as cold sores. HSV-1 utilizes the host cell nucleus for genome replication and nucleocapsid assembly. Nuclear interior is occupied by viral replication compartments, whereas the host chromatin becomes compressed and marginalized to the nuclear periphery. Progeny nucleocapsids exit the intact nucleus by budding through the nuclear envelope. While the mechanism of nuclear egress has been well-characterized, less is known about progeny nucleocapsid movement among the host chromatin to the inner nuclear membrane. The aim of this study was to observe the properties of host chromatin in relation to viral replication compartments and progeny nucleocapsids during the late phase of lytic HSV-1 infection. In order to gain a more detailed look into the host chromatin as a structural element, we studied the redistribution of the loosely packed active euchromatin and the compacted silent heterochromatin by labeling their respective histone post-translational modifications. Confocal and transmission electron microscopy (TEM) imaging of HSV-1 infected nuclei showed that the marginalized host chromatin forms an uneven ring, which contains gaps that allow progeny nucleocapsids to access the inner nuclear membrane for egress. Nanometer-scale visualization of nucleocapsids in TEM images revealed that nucleocapsids are frequently surrounded by an electron-lucent, halo-like space, which might be related to nucleocapsid movement through the host chromatin. Notably, active euchromatin appears in the nuclear periphery adjacent to the inner nuclear membrane upon infection, although it is yet unclear if this finding represents virally activated euchromatin. Chromatin remodeling is a prominent feature of lytic HSV-1 infection. Further characterization of the key interactions between host chromatin and viral components could expose critical steps in HSV-1 nuclear egress, which might have additional value as therapeutic targets of this widespread human virus.en
dc.format.extent1 verkkoaineisto (42 sivua)
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isoeng
dc.rightsJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.rightsThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.subject.otherHSV-1
dc.subject.otherherpesvirukset
dc.subject.othertuma
dc.subject.otherkromatiini
dc.subject.othervirus-tuma-vuorovaikutukset
dc.titleVirus-nucleus interactions in late herpesvirus infection
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-201801031024
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.type.ontasotMaster’s thesisen
dc.contributor.tiedekuntaMatemaattis-luonnontieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sciencesen
dc.contributor.laitosBio- ja ympäristötieteiden laitosfi
dc.contributor.laitosDepartment of Biological and Environmental Scienceen
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.oppiaineSolu- ja molekyylibiologiafi
dc.contributor.oppiaineCell and molecular biologyen
dc.date.updated2018-01-03T08:38:38Z
dc.rights.accesslevelopenAccessfi
dc.type.publicationmasterThesis
dc.contributor.oppiainekoodi4013
dc.subject.ysoherpes simplex -virus
dc.subject.ysoherpesvirukset
dc.subject.ysotuma
dc.format.contentfulltext
dc.type.okmG2


Aineistoon kuuluvat tiedostot

Thumbnail

Aineisto kuuluu seuraaviin kokoelmiin

Näytä suppeat kuvailutiedot