Show simple item record

dc.contributor.authorTakanen, Anna
dc.date.accessioned2017-05-02T12:32:25Z
dc.date.available2017-05-02T12:32:25Z
dc.date.issued2017
dc.identifier.otheroai:jykdok.linneanet.fi:1700279
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/53737
dc.description.abstractSydäntaudit ovat johtava kuolinsyy maailmanlaajuisesti, ja siksi potilasspesifisien lääketestausmallien sekä kudosregeneraation tutkimus on ajankohtainen aihe. Nykyinen teknologia ei pysty vielä tuottamaan suuria määriä puhtaita ihmisen indusoiduista pluripotenteista kantasoluista (hiPSC) erilaistettuja sydänsoluja tarpeeksi tehokkaasti, jotta niitä voitaisiin käyttää regeneratiivisessa lääketieteessä ja luotettavammassa lääketestauksessa. Sydänsolujen tuottamista ja karakterisointia täytyy kehittää. Tämän tutkimuksen tavoite oli jatkaa potilasspesifisten hiPSC sydänsolujen erilaistamisen karakterisoimista ja testata oletetun sydänsolujen erilaistusta tehostavan pienmolekyylin (PCDE) vaikutusta erilaistamisen tehokkuuteen. Hypoteesi oli, että kyseinen pienmolekyyli parantaisi erilaistustehokkuutta. Erilaistustehokkuutta mitattiin virtaussytometrisesti sydänmarkkerilla, Troponiin T:llä, ja kardiomyosiitit karakterisoitiin immunovärjäyksillä sekä kvantitatiivisen polymeraasiketjureaktion (qPCR) avulla. Geeniekspressiota analysoitiin RNA-näytteistä erilaistuksen eri vaiheista. Tutkimuksen aikana arvioitiin tekniikkana videopohjaista yksittäisten solujen sykeanalyysia, joka on tietokoneohjelmaan pohjautuva tukeva tutkimusmenetelmä yksittäisten solujen sykekuvion määrittämiseksi. Tuloksiin perustuen PCDE ei onnistunut tehostamaan hiPSC sydänsolujen erilaistamista ja saattoi vähentää sydänmarkkereiden ekspressiota. Totesimme kuitenkin, että videopohjaista sykeanalyysiä voitaisiin käyttää yhdessä yksittäisten solujen PCR-tutkimusten kanssa sydänsolujen paremman karakterisoinnin saavuttamiseksi.fi
dc.description.abstractCardiac disease remains the leading cause of death in the world. Therefore, the need for patient specific drug testing models, as well as tissue regeneration, are hot topics in medicine. The modern technology is still unable to efficiently produce pure cultures of human induced stem cell (hiPSC) derived cardiomyocytes, which are needed for several purposes including regenerative medicine and reliable drug testing for cardiac disease. Further development of hiPSC derived cardiomyocyte differentiation and characterization techniques is required. The objective of this experiment was to further characterize the differentiation of hiPSC derived cardiomyocytes obtained from patients and to test the effects of a novel putative cardiac differentiation enhancing small molecule (PCDE), on the efficiency of differentiation. The hypothesis was that the small molecule would increase the differentiation efficiency. The efficiency was tested with flow cytometry using a cardiac marker, Troponin T, and the cardiomyocytes were characterized by immunostaining and quantitative polymerase chain reaction (qPCR). Gene expression was analyzed from RNA samples collected from different time points of differentiation. During the experiment video-based beating analysis, a robust technique that utilizes a computer program to characterize beating patterns of single cardiomyocytes, was evaluated as a technique. Based on all results PCDE failed to enhance the differentiation efficiency of hiPSC derived cardiomyocytes and may have reduced the expression of cardiac markers. However, we found that the video based beating analysis could be used in combination with single cell PCR to better characterize cardiomyocytes.en
dc.format.extent1 verkkoaineisto (41 sivua)
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isoeng
dc.rightsJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.rightsThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.titleNovel small molecule in differentiation of hiPSC derived cardiomyocytes and single cell beating analysis
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-201705022145
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.type.ontasotMaster’s thesisen
dc.contributor.tiedekuntaMatemaattis-luonnontieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sciencesen
dc.contributor.laitosBio- ja ympäristötieteiden laitosfi
dc.contributor.laitosDepartment of Biological and Environmental Scienceen
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.oppiaineSolu- ja molekyylibiologiafi
dc.contributor.oppiaineCell and molecular biologyen
dc.date.updated2017-05-02T12:32:26Z
dc.rights.accesslevelopenAccessfi
dc.type.publicationmasterThesis
dc.contributor.oppiainekoodi4013
dc.subject.ysokantasolut
dc.subject.ysosolut
dc.format.contentfulltext
dc.type.okmG2


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record