Riskitiheyskuvio Coxin mallin diagnostiikassa ja tulkinnassa sekä sen toteuttaminen R-ympäristöön

Abstract

Tutkielmassa esitellään riskitiheyskuvio, jota voidaan käyttää Coxin suhteellisten riskitiheyksien mallin tulosten sekä aineiston havainnollistamisessa. Kaikki mallissa olevat kovariaatit voidaan piirtää samaan kuvaan, sillä vaaka-akselin koordinaattina käytetään [0, 1]-välille skaalattuja järjestyslukuja. Pystyakselille piirretään kovariaateittain suhteellinen riskitiheys, joka on mallin antama riskitiheys jaettuna riskitiheydellä vertailukohdassa kuten kovariaatin mediaanissa.

Riskitiheyskuvio mahdollistaa mallissa olevien kovariaattien keskinäisen merkityksen arvioinnin populaatiotasolla. Riskitiheyskuviota voidaan käyttää myös kovariaatin muunnosten tulkinnalliseen vertailuun. Kuvio näyttää mallin antamat suhteelliset riskitiheydet kovariaattien minimissä ja maksimissa, ja sen avulla voidaan siis arvioida, tuottaako suhteellisten riskitiheyksien oletus järkeviä riskitiheyden estimaatteja havaintoyksiköille, joilla on havaittu äärimmäisiä arvoja kovariaateilla. Lisäksi esitetään esimerkki riskitiheyskuvion hyödyntämisestä Coxin mallille, jossa on ajassa muuttuvia kovariaatteja.

Riskitiheyskuvio voidaan piirtää R-ympäristön rankhazard-pakettia käyttäen. Tutkielman pääpaino on ollut rankhazard-paketin päivittämisess ä aiemmasta versiosta 0.8-1. Tutkielman tuloksena paketista julkaistiin R-ohjelmapakettien kokoelmaan (The Comprehensive R Archive Network) versio 1.0. Siihen on korjattu edellisen version puutteita sekä lisätty uusia ominaisuuksia. Nyt malleissa voi käyttää sekä faktoreita että muunnoksia. Lisäksi suhteellisen riskitiheyden luottamusvälien piirtäminen on mahdollista, ja muun muassa graafsia ominaisuuksia on parannettu lisäargumenttien myötä.