Jyväskylän yliopisto | JYX-julkaisuarkisto

  • suomi  | Anna palautetta |
    • suomi
    • English
 
  • Kirjaudu
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
Näytä aineisto 
  • JYX
  • Opinnäytteet
  • Pro gradu -tutkielmat
  • Näytä aineisto
JYX > Opinnäytteet > Pro gradu -tutkielmat > Näytä aineisto

The effects of growth medium on Flavobacterium columnare colony morphology and its phage resistance mechanisms

Thumbnail
Katso/Avaa
674.2 Kb

Lataukset:  
Show download detailsHide download details  
Tekijät
Smith, Katie
Päivämäärä
2019
Oppiaine
Akvaattiset tieteetAquatic sciences
Tekijänoikeudet
Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.

 
The freshwater bacterium Flavobacterium columnare is known to exhibit different morphologies when cultured in different media with bacteriophage. This could influence the type of phage-resistance mechanisms the bacteria use, such as CRISPR-Cas system or alterations which reduce bacteriophage adsorption. In this study the different morphologies which arise in different media when treated with bacteriophage was investigated to identify their favoured phage-resistance mechanism. The bacteria were screened for acquisition of new CRISPR spaces and tested for changes in phage adsorption. Results show that the growth medium itself influences the bacterial colony morphology, likely due to the difference in nutrients available. When exposed to bacteriophage, a small proportion of bacteria in HTC medium acquired new CRISPR spacers, however, the preferred phage-resistance mechanism appears to be something other than CRISPR-Cas overall, in SHIEH and HTC. Improved understanding of bacterial resistance mechanisms is useful towards the development of bacteriophage therapies. ...
Asiasanat
Flavobacterium columnare colony morphology CRISPR-Cas Phage resistance bakteerit bakteriofagit bacteria bacteriophages
URI

http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201907303713

Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedot
Kokoelmat
  • Pro gradu -tutkielmat [23990]

Samankaltainen aineisto

Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.

  • Memoirs of a fish pathogen: how CRISPR-Cas captures phage encounters in Flavobacterium columnare 

    Hoikkala, Ville (2020)
    Bacteria are in constant interaction with their viruses, bacteriophages (phages). To prevent or abort phage infections, a variety of defence mechanisms have evolved. CRISPR-Cas, the only known adaptive bacterial immune ...
  • The influence of competition on the formation of phage resistance in Flavobacterium columnare 

    Rantanen, Noora (2021)
    Luonnossa bakteerit elävät monimutkaisissa eliöyhteisöissä, joissa ne vuorovaikuttavat paitsi keskenään, myös bakteereja infektoivien virusten, (bakterio)faagien kanssa. Bakteerien ja faagien välisen koevoluution aikana ...
  • Cooperation between Different CRISPR-Cas Types Enables Adaptation in an RNA-Targeting System 

    Hoikkala, Ville; Ravantti, Janne; Díez-Villaseñor, César; Tiirola, Marja; Conrad, Rachel A.; McBride, Mark J.; Moineau, Sylvain; Sundberg, Lotta-Riina (American Society for Microbiology, 2021)
    CRISPR-Cas immune systems adapt to new threats by acquiring new spacers from invading nucleic acids such as phage genomes. However, some CRISPR-Cas loci lack genes necessary for spacer acquisition despite variation in ...
  • Comparison of Delivery Methods in Phage Therapy against Flavobacterium columnare Infections in Rainbow Trout 

    Kunttu, Heidi M. T.; Runtuvuori-Salmela, Anniina; Middelboe, Mathias; Clark, Jason; Sundberg, Lotta-Riina (MDPI AG, 2021)
    Viruses of bacteria, bacteriophages, specifically infect their bacterial hosts with minimal effects on the surrounding microbiota. They have the potential to be used in the prevention and treatment of bacterial infections, ...
  • Aquaculture as a source of empirical evidence for coevolution between CRISPR-Cas and phage 

    Hoikkala, Ville; De Freitas Almeida, Gabriel; Laanto, Elina; Sundberg, Lotta-Riina (Royal Society, 2019)
    So far, studies on the bacterial immune system CRISPR-Cas and its ecological and evolutionary effects have been largely limited to laboratory conditions. While providing crucial information on the constituents of CRISPR-Cas, ...
  • Selaa aineistoja
  • Selaa aineistoja
  • Artikkelit
  • E-kirjat
  • Esitelmät ja posterit
  • Historialliset kartat
  • Julkaisusarjat
  • Konferenssit ja seminaarit
  • Lehdet
  • Opinnäytteet
  • Oppimateriaalit
  • Nuotit ja musiikki
  • Tutkimusdata
  • Tutkimusraportit
  • Valokuvat

Selaa

Kaikki aineistotKokoelmaluetteloJulkaisupäivätTekijätAsiasanatJulkaistuLaitosOppiaine

Omat tiedot

Kirjaudu sisään

Tilastot

Tarkastele käyttötilastoja
  • Kuinka julkaista JYXissä?
  • Rinnakkais­tallentaminen
  • Opinnäytteiden julkaisu
  • Väitöskirjojen julkaisu
  • Julkaisupalvelut

Avoin tiede JYU:ssa
 
Tietosuojailmoitus

Saavutettavuusseloste

Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.
Open Science Centre