AKR1C3-entsyymin tuotto-, puhdistus- ja kiteytysolosuhteiden optimointi

Keisanen, Anni

dc.contributor.advisor	Haataja, Tatu
dc.contributor.advisor	Pentikäinen, Ulla
dc.contributor.author	Keisanen, Anni
dc.date.accessioned	2018-11-02T07:55:04Z
dc.date.available	2018-11-02T07:55:04Z
dc.date.issued	2018
dc.identifier.uri	https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/60085
dc.description.abstract	Aldo-keto-reduktaasi (AKR) kuuluu oksidoreduktaasin superperheeseen. Ihmisen (Homo sapiens) AKR1C3 (aldo-keto reduktaasi C3) säätelee elimistön hormonituotantoa osallistumalla prostaglandiini- ja steroidisynteeseihin. Häiriöt AKR1C3-geenin toiminnassa vaikuttavat ratkaisevasti erilaisten sairauksien, kuten hormoniriippuvaisten syöpien syntymiseen. Tällä hetkellä kliiniseen käyttöön ei ole hyväksytty yhtään AKR1C3-entsyymiin kohdennettua lääkeainetta. Tutkimuksen tavoitteena oli optimoida rekombinanttisen AKR1C3-proteiinin tuotto- ja puhdistusolosuhteet sekä tutkia tietokonemallinnuksella suunniteltujen molekyylien sitoutumista AKR1C3-entsyymiin. Tuotto- ja puhdistusmenetelmien optimoinnissa onnistuttiin saamaan 0.5 l tuotolla 11.9 mg 96.5 % puhdasta AKR1C3- proteiinia. Molekyylien sitoutumista AKR1C3-entsyymiin tutkittiin lämpötilariippuvaisella fluoresenssispektroskopialla. 64 tutkitusta molekyylistä 6 molekyyliä sitoutui AKR1C3-entsyymiin. Molekyylien sitoutumismuodon määrittämiseksi AKR1C3-entsyymi ja ligandi kiteytettiin riippuva pisara – menetelmän sekä liuotuskokeen avulla. Muodostuneista kompleksikiteissä havaittiin diffraktiota röntgenkristallografialla (MASSIF-1, ESRF). Tutkimuksessa löydettiin uusi suunta AKR1C3-kohdennetun lääkkeen kehittämiseen – kumariinijohdannaiset ligandit.	fi
dc.format.extent	53
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.language.iso	fi
dc.rights	In Copyright	en
dc.subject.other	lämpötilariippuvainen fluoresenssispektroskopia
dc.subject.other	yhdistelmäDNA-tekniikka.
dc.title	AKR1C3-entsyymin tuotto-, puhdistus- ja kiteytysolosuhteiden optimointi
dc.type	master thesis
dc.identifier.urn	URN:NBN:fi:jyu-201811024606
dc.type.ontasot	Pro gradu -tutkielma	fi
dc.type.ontasot	Master’s thesis	en
dc.contributor.tiedekunta	Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta	fi
dc.contributor.tiedekunta	Faculty of Sciences	en
dc.contributor.laitos	Bio- ja ympäristötieteiden laitos	fi
dc.contributor.laitos	Department of Biological and Environmental Science	en
dc.contributor.yliopisto	Jyväskylän yliopisto	fi
dc.contributor.yliopisto	University of Jyväskylä	en
dc.contributor.oppiaine	Biologian opettajankoulutus	fi
dc.contributor.oppiaine	Teacher education programme in Biology	en
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.rights.accesslevel	openAccess
dc.type.publication	masterThesis
dc.contributor.oppiainekoodi	4014
dc.subject.yso	röntgenkristallografia
dc.subject.yso	lääkeaineet
dc.subject.yso	kumariinit
dc.subject.yso	kiteytys
dc.subject.yso	entsyymit
dc.format.content	fulltext
dc.rights.url	https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/
dc.type.okm	G2

Aineistoon kuuluvat tiedostot

Nimi:: URN:NBN:fi:jyu-201811024606.pdf
Koko:: 1.384Mb
Tiedostomuoto:: PDF

Katso/Avaa

Aineisto kuuluu seuraaviin kokoelmiin

Pro gradu -tutkielmat [29742]

Näytä suppeat kuvailutiedot

Ellei muuten mainita, aineiston lisenssi on In Copyright

Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.

In vitro glucuronidation of 7-hydroxycoumarin derivatives in intestine and liver microsomes of Beagle dogs

Juvonen, Risto O.; Heikkinen, Aki T.; Kärkkäinen, Olli; Jehangir, Rabia; Huuskonen, Juhani; Troberg, Johanna; Raunio, Hannu; Pentikäinen, Olli T.; Finel, Moshe (Elsevier BV, 2020)

Beagle dog is a standard animal model for evaluating nonclinical pharmacokinetics of new drug candidates. Glucuronidation in intestine and liver is an important first-pass drug metabolic pathway, especially for phenolic ...
In vitro sulfonation of 7-hydroxycoumarin derivatives in liver cytosol of human and six animal species

Juvonen, Risto O.; Pentikäinen, Olli; Huuskonen, Juhani; Timonen, Juri; Kärkkäinen, Olli; Heikkinen, Aki; Fashe, Muluneh; Raunio, Hannu (Taylor & Francis, 2020)

1. Sulfonation is an important high affinity elimination pathway for phenolic compounds. 2. In this study sulfonation of 7-hydroxycoumarin and 13 its derivatives were evaluated in liver cytosols of human and six animal ...
Small molecule modulators of amine oxidation, nuclear receptor signaling and glucuronidation : 3-phenylcoumarin as a scaffold of interest

Rauhamäki, Sanna (University of Jyväskylä, 2018)

The costs of the drug development process are moderated as computer-aided drug design methods are able to expedite the steps required for lead identification. In fact, computational tools are nowadays virtually ...
Molecular docking and oxidation kinetics of 3-phenyl coumarin derivatives by human CYP2A13

Juvonen, Risto O.; Jokinen, Elmeri M.; Huuskonen, Juhani; Kärkkäinen, Olli; Raunio, Hannu; Pentikäinen, Olli T. (Informa Healthcare, 2021)

1.CYP2A13 enzyme is expressed in human extrahepatic tissues, while CYP2A6 is a hepatic enzyme. Reactions catalyzed by CYP2A13activate tobacco-specificnitrosamines and some other toxic xenobioticsin lungs. 2.To compare ...
Structure-Activity Relationship Analysis of 3-phenylcoumarin-Based Monoamine Oxidase B Inhibitors

Rauhamäki, Sanna; Postila, Pekka; Niinivehmas, Sanna; Kortet, Sami; Schildt, Emmi; Pasanen, Mira; Manivannan, Elangovan; Ahinko, Mira; Koskimies, Pasi; Nyberg, Niina; Huuskonen, Pasi; Multamäki, Elina; Pasanen, Markku; Juvonen, Risto O.; Raunio, Hannu; Huuskonen, Juhani; Pentikäinen, Olli (Frontiers Media S.A., 2018)

Monoamine oxidase B (MAO-B) catalyzes deamination of monoamines such as neurotransmitters dopamine and norepinephrine. Accordingly, small-molecule MAO-B inhibitors potentially alleviate the symptoms of dopamine-linked ...

AKR1C3-entsyymin tuotto-, puhdistus- ja kiteytysolosuhteiden optimointi

Aineistoon kuuluvat tiedostot

Aineisto kuuluu seuraaviin kokoelmiin

Samankaltainen aineisto

In vitro glucuronidation of 7-hydroxycoumarin derivatives in intestine and liver microsomes of Beagle dogs ﻿

In vitro sulfonation of 7-hydroxycoumarin derivatives in liver cytosol of human and six animal species ﻿

Small molecule modulators of amine oxidation, nuclear receptor signaling and glucuronidation : 3-phenylcoumarin as a scaffold of interest ﻿

Molecular docking and oxidation kinetics of 3-phenyl coumarin derivatives by human CYP2A13 ﻿

Structure-Activity Relationship Analysis of 3-phenylcoumarin-Based Monoamine Oxidase B Inhibitors ﻿

In vitro glucuronidation of 7-hydroxycoumarin derivatives in intestine and liver microsomes of Beagle dogs

In vitro sulfonation of 7-hydroxycoumarin derivatives in liver cytosol of human and six animal species

Small molecule modulators of amine oxidation, nuclear receptor signaling and glucuronidation : 3-phenylcoumarin as a scaffold of interest

Molecular docking and oxidation kinetics of 3-phenyl coumarin derivatives by human CYP2A13

Structure-Activity Relationship Analysis of 3-phenylcoumarin-Based Monoamine Oxidase B Inhibitors