Kultapinnan S(CH2)xN3-adsorbaattien laskennallinen värähdysdynamiikka ja 2DIR-spektroskopia molekyylidynamiikkamenetelmin

Abstract

Tehtiin MD-simulaatiot kultapinnan siltapaikkoihin kahdella eri peitolla (1/3 ja 1/4) yksikerrokseksi asetetuille pitkä- ja lyhytketjuisille S(CH2)xN3-adsorbaateille (x = 2, 11). Kukin systeemi simuloitiin sekä tyhjiössä että vesiympäristössä. Simulaatioista määritettiin atsidiryhmien FFCF:t ja CLS:t odotusaikavälille t2 ∈ [0, 200] ps. Näihin sovitettiin multieksponentiaaliset funktiot ja havaittiin FFCF:n hitaiden komponenttien vastaavan CLS-komponentteja. Lisäksi tarkasteltiin mallia, joka esittää CLS:n ja FFCF:n välille suoraviivaisen yhteyden ja mahdollistaa Lorentzin ja Gaussin leveyksien määrittämisen. Malli todettiin hyvin toimivaksi simulaatioista saatujen tulosten tapauksessa.

MD simulations were ran for S(CH2)xN3 (x = 2, 11) monolayers of coverage 1/3 and 1/4 on the bridge sites of an Au(111) surface. Each system was simulated in both vacuum and water environments. The FFCF and CLS functions for the azide groups in the waiting time range t2 ∈ [0, 200] ps were determined from the simulations. These were fitted with multiexponential functions, and the slow components of the FFCF curves were found to correspond to the CLS components. In addition a model that straightforwardly connects the CLS to the FFCF and allows one to determine the Lorentzian and Gaussian linewidths was considered. The model was found to perform well in the case of the presented simulation results.