University of Jyväskylä | JYX Digital Repository

  • English  | Give feedback |
    • suomi
    • English
 
  • Login
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
View Item 
  • JYX
  • Opinnäytteet
  • Pro gradu -tutkielmat
  • View Item
JYX > Opinnäytteet > Pro gradu -tutkielmat > View Item

Effect of substrate rigidity on distribution of nuclear actin and lamin A

Thumbnail
View/Open
2.2 Mb

Downloads:  
Show download detailsHide download details  
Authors
Ijäs, Tommi
Date
2016
Discipline
Solu- ja molekyylibiologiaCell and molecular biology

 
Tämä tutkimus keskittyi analysoimaan, onko solun ulkopuolisen ympäristön jäykkyydellä vaikutusta tuman sisäisten proteiinien jakautumiseen. Tuman mekanosensitiivisyyden vaikutusta lamiini A:n ja aktiinin sijaintiin tumassa tutkittiin soluilla, joita kasvatettiin eri jäykkyisillä kasvualustoilla. Kokeissa laskettiin lamiini A:n suhteellinen määrä vertaamalla tumalevyyn sitoutunutta ja tumassa vapaana olevaa lamiini A:ta, sekä suhteellinen määrä aktiinille vertaamalla tumansisäisen aktiinin määrää solulimassa olevaan. Kahta eri jäykkyistä (1,5 kPa ja 33 kPa Youngin moduluksella) polyakryyliamidi (PAA)-geeliä käytettiin säädettävänä kasvualustana soluille. Näillä geeleillä kasvatettiin hiiren 3T3 fibroblastisoluja, joihin oli transfektoitu konstrukti, joka ilmentää joko lamiini A:ta tai aktiinia tehostetulla vihreällä fluoresoivalla proteiinilla (EGFP) leimattuna. Proteiineja ilmentäviä soluja kuvannettiin laser-skannaus konfokaalimikroskoopilla. Data käsiteltiin ja analysoitiin imageJ-ohjelmalla ja lopulliset tulokset saatiin vertaamalla tuman sisäistä vapaata lamiini A:ta tumalevyyn sistoutuneeseen, sekä aktiinille vertaamalla tuman sisäisen aktiinin intensiteettiä solulimasta saatuun intensiteettiin. Lamiini A:lle tulokset näyttivät, että suurempi jäykkyys vaikuttaa lamiini A:n dynamiikkaan suurentamalla tumalimassa vapaana olevan lamiini A:n määrää suhteessa tumalevyyn sitoutuneeseen. Aktiinille tulokset olivat vähemmän yhteneviä tutkimuksen aikana, mutta myös tumansisäisen aktiinin määrä vaikuttaisi kasvavan jäykemmällä alustalla suhteutettuna soluliman aktiinipitoisuuteen. Lamiini A:n suhteen on kuitenkin näytetty että sen kokonaispitoisuus kasvaa ja fosforyloidun lamiini A:n määrä vähenee kun solu on jäykemmässä ympäristössä. Vaikka nämä tulokset eivät suoranaisesti tuekkaan toisiaan, osoitettiin tutkimuksessa alustan jäykkyyden vaikuttavan sitoutuneen ja vapaan lamiini A:n suhteeseen. Aktiinista saadut tulokset tukevat tietoja aktiinin aktiivisen tumakuljetuksen kasvamisesta kun solu joutuu rasituksen alaiseksi. Molemmat tulokset kuitenkin osoittavat jäykkyydellä olevan suora vaikutus tuman proteiinien dynamiikkaan. ...
 
In this study we aimed to see if the rigidity of the extracellular environment can influence protein distribution within the nucleus. The effect of nuclear mechanosensing on the spatial localization of lamin A and actin was studied in cells cultured on different rigidity cell culture substrates. We quantified the relative levels of lamin A in nuclear lamina vs. nucleoplasm and the amount of intranuclear actin vs. cytoplasmic actin. Two different rigidities (1.5 kPa and 33 kPa of Young's modulus) of polyacrylamide (PAA)-gels were used as a tunable substrate for the cells. On these gels, we cultured mouse 3T3 fibroblast cells, which were transfected with enhanced green fluorescent protein (EGFP) labeled lamin A and actin. Cultured cells we imaged with laser scanning confocal microscope. Images were processed and analyzed using imageJ and comparisons were made between mean intensities of lamin A in the nuclear lamina and nucleoplasm, and between intranuclear and cytoplasmic actin. With lamin A, the results showed that a higher rigidity affects lamin A dynamics, by a significant increase of free lamin A in relation to bound lamin A. With actin, the results were more unclear, but the same trend seems to continue. Actin amount inside nucleus seemed to increase related to cytoplasmic actin, when the cells were cultured on more rigid substrate. In both cases, substrate rigidity affected the protein dynamics by increasing free protein inside nucleus. Actin also seems to be actively taken into nucleus in larger quantities in more rigid environment. It has been recently shown that stiffer substrate increases lamin A amount and decreases phosphorylated lamin A, which might contradict our results. The effect of substrate rigidity on actin regulation is still poorly understood, but our results seem to be in line with proposed actin active intake to nucleus at cellular stress. Still, both of these results signify that cells have more direct mechanisms of sensing inside nucleus to affect nuclear activities. ...
 
Keywords
lamiini A polyakryyliamidi solut aktiinit tuma jäykkyys
URI

http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201606193209

Metadata
Show full item record
Collections
  • Pro gradu -tutkielmat [24521]

Related items

Showing items with similar title or keywords.

  • Effects of ageing on Achilles tendon properties and triceps surae muscle architecture in vivo 

    Stenroth, Lauri (2012)
    Achilles tendon is the largest tendon in human body and it has an important role in human locomotion. Ageing is associated with lowered muscle function and the changes in tendon properties could have a major role in ...
  • Effect of Training-Induced Changes in Achilles Tendon Stiffness on Muscle–Tendon Behavior During Landing 

    Werkhausen, Amelie; Albracht, Kirsten; Cronin, Neil; Paulsen, Gøran; Bojsen-Møller, Jens; Seynnes, Olivier R. (Frontiers Research Foundation, 2018)
    During rapid deceleration of the body, tendons buffer part of the elongation of the muscle–tendon unit (MTU), enabling safe energy dissipation via eccentric muscle contraction. Yet, the influence of changes in tendon ...
  • Effect of substrate particle size on burrowing of the juvenile freshwater pearl mussel Margaritifera margaritifera 

    Hyvärinen, Heini; Saarinen-Valta, Mari; Mäenpää, Eero; Taskinen, Jouni (Springer, 2021)
    Juveniles of the endangered freshwater pearl mussel (FPM, Margaritifera margaritifera) live burrowed in stream substrate for the first years of their life. Fine sediments block water exchange within substrate and may cause ...
  • Open-source QCD analysis of nuclear parton distribution functions at NLO and NNLO 

    Walt, Marina; Helenius, Ilkka; Vogelsang, Werner (American Physical Society, 2019)
    We present new sets of nuclear parton distribution functions (nPDFs) at next-to-leading order and next-to-next-to-leading order. Our analyses are based on deeply inelastic scattering data with charged-lepton and neutrino ...
  • Spatially dependent parton distribution functions and hard processes in nuclear collisions 

    Helenius, Ilkka (University of Jyväskylä, 2014)
  • Browse materials
  • Browse materials
  • Articles
  • Conferences and seminars
  • Electronic books
  • Historical maps
  • Journals
  • Tunes and musical notes
  • Photographs
  • Presentations and posters
  • Publication series
  • Research reports
  • Research data
  • Study materials
  • Theses

Browse

All of JYXCollection listBy Issue DateAuthorsSubjectsPublished inDepartmentDiscipline

My Account

Login

Statistics

View Usage Statistics
  • How to publish in JYX?
  • Self-archiving
  • Publish Your Thesis Online
  • Publishing Your Dissertation
  • Publication services

Open Science at the JYU
 
Data Protection Description

Accessibility Statement

Unless otherwise specified, publicly available JYX metadata (excluding abstracts) may be freely reused under the CC0 waiver.
Open Science Centre