Laskennalliset menetelmät foldameeritutkimuksessa
Foldameerit ovat oligomeerejä, joilla on stabiili sekundäärirakenne eli niillä on kyky laskostua. Foldameerien syntetisointi ja karakterisointi on usein melko vaikeaa. Tästä syystä niiden rakenteen ja ominaisuuksien tutkimiseksi on kehitelty useita erilaisia laskennallisia malleja. Laskennalliset menetelmät jakautuvat kvanttimekaniikan menetelmiin ja molekyylidynamiikkaan. Molekyylidynamiikka perustuu klassiseen mekaniikkaan. Siinä yksittäisiä atomeja käsitellään palloina, joilla on muuttumaton varaus. Atomien väliset sidokset on yksinkertaistettu jousiksi, joilla on tasapainotila, joka on sama kuin kokeellinen tai laskennallinen sidospituus. Kvanttimekaniikan menetelmillä voidaan tutkia molekyylien konformaatioiden energioita, kun taas molekyylidynamiikalla pystytään mallintamaan molekyylien tai atomien käytöstä liuos- tai kiinteässä tilassa. Tässä työssä pääpaino on erityisesti molekyylidynamiikan menetelmien hyödyntämisessä foldameerien tutkimuksessa.
Asiasanat
Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedotKokoelmat
- Pro gradu -tutkielmat [29743]
Lisenssi
Samankaltainen aineisto
Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.
-
Schrödingerin yhtälön sidottujen tilojen numeerisesta ratkaisemisesta
Koskinen, Joonas (2013)Esittelemme yksiulotteisen, ajasta riippumattoman, Schrödingerin yhtälön ja siihen liittyviä potentiaalikuoppia, eli reunaehtoja. Lisäksi esittelemme kolmeulotteisen, radiaalisen, Schrödingerin yhtälön ja tutkimme siihen ... -
Spectral analysis and quantum chaos in two-dimensional nanostructures
Luukko, Perttu (University of Jyväskylä, 2015)This thesis describes a study into the eigenvalues and eigenstates of twodimensional (2D) quantum systems. The research is summarized in four scientific publications by the author. The underlying motivation for this work ... -
Application of time-dependent many-body perturbation theory to excitation spectra of selected finite model systems
Säkkinen, Niko (University of Jyväskylä, 2016)In this thesis, an approximate method introduced to solve time-dependent many-body problems known as time-dependent many-body perturbation theory is studied. Many-body perturbation theory for interacting electrons and ... -
Foldameerien isäntä-vieraskemia
Happonen, Lauri (2017)Tutkielman kirjallisessa osassa tarkastellaan foldameerejä isäntä-vieraskemian näkökulmasta. Foldameerit voivat sitoa rakenteeseensa erilaisia vierasmolekyylejä, jolloin muodostuu isäntä-vieraskomplekseja. Kirjallisuudesta ... -
Solid state conformational behavior and interactions of a series of aromatic oligoamide foldamers
Suhonen, Aku (University of Jyväskylä, 2016)The topic of this thesis is aromatic oligoamide foldamers. The literary review of the thesis discusses the general features of foldamers and their design and then focuses on the specific examples of aromatic oligoamide ...
Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.