Virtual screening : development of a novel structure-based method
Julkaistu sarjassa
Jyväskylä studies in biological and environmental scienceTekijät
Päivämäärä
2013Oppiaine
Solu- ja molekyylibiologiaJulkaisija
University of JyväskyläISBN
978-951-39-5341-6ISSN Hae Julkaisufoorumista
1456-9701Julkaisuun sisältyy osajulkaisuja
- Artikkeli I: Virtanen S.I. & Pentikäinen O.T. 2010. Efficient virtual screening using multiple protein structures described as negative images of the ligandbinding site. Journal of Chemical Information and Modeling 50: 1005–1011. DOI: 10.1021/ci100121c
- Artikkeli II: Niinivehmas S.P., Virtanen S.I., Lehtonen J.V., Postila P.A. & Pentikäinen O.T. 2011. Comparison of virtual high-throughput screening methods for the identification of phosphodiesterase-5 inhibitors. Journal of Chemical Information and Modeling 51: 1353–1363. DOI: 10.1021/ci1004527
- Artikkeli III: Virtanen S.I., Niinivehmas S.P., Pentikäinen O.T. 2015. Case-specific performance of MM-PBSA, MM-GBSA, and SIE in virtual screening. 62, (November) 303–318 DOI: 10.1016/j.jmgm.2015.10.012
Asiasanat
virtuaaliseulonta lääkeaihiot lääkeainekehitys rakennepohjaiset menetelmät laskennalliset menetelmät ligandipohjaiset menetelmät molekyylidynamiikka molekyylimekaniikka computational drug discovery binding free energy negative image-based screening molecular dynamics virtual screening lääkesuunnittelu ligandit
Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedotKokoelmat
- Väitöskirjat [3580]
Lisenssi
Samankaltainen aineisto
Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.
-
Computational studies of biomolecular screening and interactions
Niinivehmas, Sanna (University of Jyväskylä, 2015) -
A Practical Perspective : The Effect of Ligand Conformers on the Negative Image-Based Screening
Ahinko, Mira; Kurkinen, Sami; Niinivehmas, Sanna; Pentikäinen, Olli; Postila, Pekka (MDPI Center, 2019)Negative image-based (NIB) screening is a rigid molecular docking methodology that can also be employed in docking rescoring. During the NIB screening, a negative image is generated based on the target protein’s ... -
Generation and utilisation of natural product library for bioactivity screening and drug discovery
Lepola, Pirkko (2006)Uusia lääkkeitä tarvitaan jatkuvasti. Koska luonnonaineet sisältävät bioaktiivisia yhdisteitä ja uusia kemiallisia rakenteita, ne tarjoavat lähes rajattoman uusien lääkeaineiden lähteen. Bioaktiivisuusseulontaan soveltuvan ... -
Effect of ligand-binding on protein function
Ylilauri, Mikko (University of Jyväskylä, 2014) -
Structure- and Interaction-Based Design of Anti-SARS-CoV-2 Aptamers
Mironov, Vladimir; Shchugoreva, Irina A.; Artyushenko, Polina V.; Morozov, Dmitry; Borbone, Nicola; Oliviero, Giorgia; Zamay, Tatiana N.; Moryachkov, Roman V.; Kolovskaya, Olga S.; Lukyanenko, Kirill A.; Song, Yangling; Merkuleva, Iuliia A.; Zabluda, Vladimir N.; Peters, Georgy; Koroleva, Lyudmila S.; Veprintsev, Dmitry V.; Glazyrin, Yury E.; Volosnikova, Ekaterina A.; Belenkaya, Svetlana V.; Esina, Tatiana I.; Isaeva, Anastasiya A.; Nesmeyanova, Valentina S.; Shanshin, Daniil V.; Berlina, Anna N.; Komova, Nadezhda S.; Svetlichnyi, Valery A.; Silnikov, Vladimir N.; Shcherbakov, Dmitriy N.; Zamay, Galina S.; Zamay, Sergey S.; Smolyarova, Tatyana; Tikhonova, Elena P.; Chen, Kelvin H.-C.; Jeng, U-Ser; Condorelli, Gerolama; de Franciscis, Vittorio; Groenhof, Gerrit; Yang, Chaoyong; Moskovsky, Alexander A.; Fedorov, Dmitri G.; Tomilin, Felix N.; Tan, Weihong; Alexeev, Yuri; Berezovski, Maxim V.; Kichkailo, Anna S. (Wiley-VCH Verlag, 2022)Aptamer selection against novel infections is a complicated and time-consuming approach. Synergy can be achieved by using computational methods together with experimental procedures. This study aims to develop a reliable ...
Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.