Show simple item record

dc.contributor.authorEsko, Elina
dc.date.accessioned2013-01-07T16:08:27Z
dc.date.available2013-01-07T16:08:27Z
dc.date.issued2012
dc.identifier.otheroai:jykdok.linneanet.fi:1241384
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/40661
dc.description.abstractTämä Pro Gradu-tutkielma on tehty yhteistyössä Tampereen yliopiston Biolääketieteel- lisen teknologian yksikön kanssa. Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää perilipiinien vaikutusta seeprakalan fenotyyppiin käyttäen tutkimusmenetelminä geenien hiljentämistä ja mikroskopiaa. Geenit säätelevät proteiinien tuotantoa elimistössä. Jokaista proteiinia koodaa geeni, jonka toimintaan puuttumalla voidaan esimerkiksi estää kyseisen proteiinin muodos- tuminen. Morfoliinot ovat oligonukleotideja, joiden avulla voidaan tilapäisesti estää geenien toimintaa. Tässä työssä hiljennettiin morfoliinojen avulla kaksi geeniä seep- rakaloilta: perilipiini 1 ja perilipiini 5. Perilipiinit ovat lipidien varastoitumista sääteleviä proteiineja. Perilipiini 1 edesauttaa lipidien varastoitumista ja perilipiini 5 puolestaan säätelee rasvojen käyttöä energiaksi. Koska tutkittavat proteiinit vaikuttavat elimistön rasvoihin, morfoliinojen vaikutusta tutkittiin lipidivärjäyksellä. Värjäyksessä käytettiin Nile Red- ja LD540-lipidivärejä. Tu- losten perusteella voitiin todeta, että perilipiini 5 eliminointi lisäsi seeprakalojen rasvap- itoisuutta ja muutti selvästi niiden ulkomuotoa. Perilipiini 1 tapauksessa huomattiin, että geenin hiljentäminen tuotti alikehittyneitä, erittäin epämuodostuneita kaloja. Lipidivär- jäyksen tuloksena havaittiin, että rasvan määrä oli näillä kaloilla hieman vähäisempi kuin kontrolleina käytetyillä villityypin kaloilla. Morfoliinokonsentraatiolla todettiin ol- evan vaikutusta lopputulokseen ja kalojen selviytymiseen. Perilipiini 1 tapauksessa par- haat tulokset saatiin 175 ng/nl konsentraatiolla, suuremmat pitoisuudet nostivat al- kioiden kuolleisuutta dramaattisesti. Perilipiini 5 tapauksessa sopivin morfoliinokonsen- traatio oli huomattavasti korkeampi ja parhaat tulokset saatiin 500 ng/nl konsentraati- olla. Alhaisemmilla pitoisuuksilla vaikutukset eivät näkyneet kovin selkeästi. Lipidien todellisen määrän selvittäminen vaatii lisätutkimuksia, sillä tässä työssä käytetty menetelmä on hyvin epätarkka ja perustuu visuaaliseen arviointiin. Jatko- tutkimuksissa tulee myös käyttää kontrollimorfoliinoa, jotta morfoliinon itsensä aiheut- tamat sivuvaikutukset saadaan eliminoitua.fi
dc.description.abstractThis study has been done in cooperation with Institute of Biomedical Technology, Uni- versity of Tampere. Aim of the study was to perilipin proteins on the phenotype of zebrafish by using gene silencing and microscopy. Protein production is regulated by genes. For each protein there is a gene coding it and by manipulating the gene for example production of the protein can be prevented. Mor- pholinos are oligonucleotides which can temporarily knock down genes. In this study, two perilipin coding genes were knocked down in zebrafish: perilipin 1 and perilipin 5. Perilipins regulate lipid storage and usage in lipid droplets. Perilipin 1 increases lipid ac- cumulation and storage and perilipin 5 helps body to use lipids as energy. Because perilipins have an effect on the lipids, lipid staining was used to see the effect of Morpholinos. Nile Red and LD540 dyes were used for staining. According to results, knocking down perilipin 5 increases the lipid content in zebrafish and has an effect on the appearance. Knocking down perilipin 1 produced extremely poorly developed indi- viduals. Lipid content of these fish was slightly smaller than that of wild type control fish. The concentration of Morpholinos had significant effect on results and survival rate. With perilipin 1 too high Morpholino concentration produced dramatically poorly developed embryos. The Morpholino concentration of 175 ng/nl produced the best res- ults. With perilipin 5 the concentration of injection solution needed to be higher, the best results were got with the concentration of 500 ng/nl. More studies should be done to determine the real amount of lipids, because in this study lipid content was only estimated visually. In future studies control Morpholinos should also be used to eliminate side effects caused by Morpholino itself.en
dc.format.extent74 sivua
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isoeng
dc.rightsThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.rightsJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.subject.othermorfoliino
dc.subject.otherperilipiini
dc.titleEffects of perilipin I & V on the phenotype of zebrafish embryos
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-201301071015
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.type.ontasotMaster’s thesisen
dc.contributor.tiedekuntaLiikuntatieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sport and Health Sciencesen
dc.contributor.laitosLiikuntabiologian laitosfi
dc.contributor.laitosDepartment of Biology of Physical Activityen
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.oppiaineLiikuntafysiologiafi
dc.contributor.oppiaineExercise Physiologyen
dc.date.updated2013-01-07T16:08:28Z
dc.rights.accesslevelopenAccessfi
dc.type.publicationmasterThesis
dc.contributor.oppiainekoodi5011
dc.subject.ysoseeprakala
dc.subject.ysolipidit
dc.subject.ysoproteiinit
dc.subject.ysogeenit
dc.format.contentfulltext
dc.type.okmG2


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record