Diverse roles of noncovalent interactions in supramolecular systems based on resorcinarenes and calix[4]pyrroles.
Julkaistu sarjassa
JYU DissertationsTekijät
Päivämäärä
2024Tekijänoikeudet
© The Author & University of Jyväskylä
Tässä väitöskirjassa tutkitaan kahden erilaisen makrosyklisten luokan yhdisteiden, kaliks[4]resorsinareenien ja kaliks[4]pyrrolien synteesiä, rakenteellista käyttäytymistä ja isäntä-vieras-sitoutumisominaisuuksia. Nämä yhdisteet kuuluvat laajempaan kaliksareenien yhdisteryhmään.
Väitöskirjan ensimmäinen osa antaa yleiskatsauksen kalikspyrrolien ja resorsinareenien kemiaan näyttäen kehityksen sen juurilta nykyaikaisiin edistysaskeleihin. Tekstissä tarkastellaan yhdisteiden synteesiä ja sitoutumisominaisuuksia erityyppisten substraattien, kuten anionien, kationien ja pienten orgaanisten molekyylien kanssa, korostaen synteettisten strategioiden ja funktionalisoinnin merkitystä anioneja sitovien ominaisuuksien ja selektiivisyyden parantamisessa mahdollisissa sovelluksissa, kuten kontrolloiduissa tunnistamisessa tai kalvon läpi tapahtuvassa kuljetuksessa. Lisäksi teksti korostaa kaliks[4]pyrroli- ja resorsinareeniyksiköiden kykyä järjestäytyä hallitusti supramolekulaariksi dimeerisiksi kapseleiksi, jotka osoittavat niiden potentiaalin luoda dynaamisia ja palautuvia kapselointijärjestelmiä, joissa on erilaisia toimintoja.
Kokeellisen ensimmäisen osa korostaa kahden kaliksi[4]resorsinareeni-johdannaisen synteesiä ja konformaatiodynamiikkaa. Erityisesti podandi 5, joka sisältää sulfonyyliryhmän kiinnittyneenä sen 1,2-dioksietaaniketjuun, esiintyy selkeästi venekonformaatiossa, jossa aromaattinen onkalo sisällyttää 1,2-dioksietaaniketjun molekyylin sisäisessä inkluusiossa C-H⋅⋅⋅π-vuorovaikutusten ohjaamana. Toisaalta podandi 6, josta puuttuu vetysidosakseptoriryhmät, osoittaa vähentyneen aromaattisen onkalon koon erilaisista käsivarren konformaatioista johtuen. Vaihtuvan lämpötilan 1H NMR -kokeet paljastivat vaihdon venekonformaatiosta toiseen ja 1,2-dioksietaaniketjun inkluusion dynamiikkaa liuoksessa, joissa molemmilla podandilla oli samanlaiset energiavallit.
Toinen osa keskittyy aryylipidennetyn meso-p -hydroksifenyyli-kaliks[4]pyrrolin synteesiin, jossa p-hydroksiasetofenoni reagoi kondensaatioreaktiolla pyrrolin kanssa, ja reaktiotuotteesta erotetaan selektiivisesti αααα-isomeeri. Röntgenkristallografialla ja spektroskooppisilla tekniikoilla saadut tulokset paljastivat erilaisia supramolekulaarisia rakenteita yhteiskiteytyksessä eri anionien ja neutraalien polaaristen vieraiden kanssa. NMR-titraukset osoittivat vahvaa vetysidoksiin perustuvaa vuorovaikutusta anionien kanssa. Tuloksia tukevat laskennalliset tutkimukset, jotka korostavat dispersiivisten vuorovaikutusten ja ekso-ontelokonfiguraatioiden roolia.
Viimeisessä osassa tarkastellaan kaksihaaraisten kaliksi[4]pyrrolien synteesiä keskittyen niiden anionien sitoutumisominaisuuksien karakterisointiin. Massaspektrometrian tukemat sitoutumistutkimukset paljastivat urearyhmiä sisältävän cis-13:n selektiivisen kompleksinmuodostuksen ja laajemman affiniteetin kloridi-ioneihin. Lusigeniinimäärityksellä arvioitu kloridin kuljetusaktiivisuus osoitti tehokkaan Cl-/NO3- antiporttimekanismin mallilipidivesikkeleissä cis-13:lle, vaikka cis-10 ilman urearyhmiä osoitti vähäistä aktiivisuutta. Vähentynyt kuljetustehokkuus SO42-:lla vahvisti ehdotetun mekanismin.
Avainsanat: resorsinareeni, kaliks[4]pyrroli, supramolekulaarinen kemia, anionin sitoutuminen, anionin kuljetus, liposomi The following thesis investigates the synthesis, structural behavior, and host-guest binding characteristics of two distinct classes of macrocyclic compounds: calix[4]resorcinarenes and calix[4]pyrroles, which belong to the broader family of calixarenes.
The first part of the thesis gives an overview of the evolution of calixpyrrole and resorcinarene chemistry from its roots to modern advancements. The text explores their synthesis and binding properties with different types of substrates such as anions, cations, and small organic molecules, emphasizing the importance of synthetic strategies and functionalization in enhancing anion-binding properties and selectivity with potential applications in controlled recognition or transmembrane transport. Additionally, the text highlights the ability of calix[4]pyrrole and resorcinarene units to controlled assembly into supramolecular dimeric capsules showcasing their potential in creating dynamic and reversible encapsulation systems with diverse functionalities.
The first part of the experimental section highlights the synthesis and conformational dynamics of two calix[4]resorcinarene derivatives. Notably, podand 5, containing a sulfonyl group attached to its 1,2-dioxyethane chain, adopts a distinctive boat conformation with an aromatic cavity filled through intramolecular self-inclusion driven by C−H⋅⋅⋅π interactions. Conversely, podand 6, lacking hydrogen bond acceptor groups, shows a reduced aromatic cavity due to different arm conformations. Variable-temperature 1H NMR experiments revealed the dynamics of the boat-to-boat exchanges and self-inclusion phenomena in solution, with similar energy barriers for both podands.
The second part focuses on the synthesis of aryl-extended meso-p-hydroxylphenylcalix[4]pyrrole via the condensation of pyrrole with p-hydroxyacetophenone, where the αααα-isomer was selectively separated. Results obtained via X-ray crystallography and spectroscopic techniques revealed diverse supramolecular structures upon co-crystallization with various anions and neutral polar guests. NMR titrations indicated strong hydrogen bonding interactions with anions, supported by computational studies emphasizing the role of the dispersive interactions and the exo-cavity configurations.
The final section explores the synthesis and characterization of two-armed calix[4]pyrroles, with a focus on their anion-binding properties. Binding studies supported with mass spectrometry revealed selective complexation and broader binding tendencies towards chloride ions by cis-13 appended with urea groups. Chloride transport activity, assessed via lucigenin assay, demonstrated efficient Cl-/NO3- antiport mechanisms in model lipid vesicles for cis-13, while cis-10 lacking the urea groups showed minimal activity. Reduced transport efficiency with SO42- confirmed the proposed mechanism.
Keywords: resorcinarene, calix[4]pyrrole, supramolecular chemistry, anion binding, anion transport, liposome
Julkaisija
Jyväskylän yliopistoISBN
978-952-86-0398-6ISSN Hae Julkaisufoorumista
2489-9003Julkaisuun sisältyy osajulkaisuja
- Artikkeli I: Pamuła, M., Nissinen, M., & Helttunen, K. (2020). Correlating Solution‐ and Solid‐State Structures of Conformationally Flexible Resorcinarenes : Significance of a Sulfonyl Group in Intramolecular Self‐Inclusion. Chemistry : A European Journal, 26(33), 7374-7383. DOI: 10.1002/chem.201905211
- Artikkeli II: Pamuła, M., Bulatov, E., & Helttunen, K. (2023). Binding of ion pairs and neutral guests by aryl-extended meso‑p-hydroxyphenyl calix[4]pyrrole : The interplay between three binding sites. Journal of Molecular Structure, 1273(5), Article 134268. DOI: 10.1016/j.molstruc.2022.134268
- Artikkeli III: Pamuła, M., Bulatov, E., Martínez-Crespo, L., Kiesilä, A., Naulapää, J., Kalenius, E., & Helttunen, K. (2023). Anion binding and transport with meso-alkyl substituted two-armed calix[4]pyrroles bearing urea and hydroxyl groups. Organic and Biomolecular Chemistry, 21(32), 6595-6603. DOI: 10.1039/d3ob00919j
Metadata
Näytä kaikki kuvailutiedotKokoelmat
- JYU Dissertations [870]
- Väitöskirjat [3599]
Lisenssi
Samankaltainen aineisto
Näytetään aineistoja, joilla on samankaltainen nimeke tai asiasanat.
-
CCDC 750239: Experimental Crystal Structure Determination
Salorinne, K.; Nissinen, Maija; Frohlich, R. (University of Jyväskylä; Contact details: Open Science Centre, University of Jyväskylä, email: jyx@jyu.fi, website: https://osc.jyu.fi/en, 2014) -
Anion Responsive Molecular Switch Based on a Doubly‐Strapped Calix[4]pyrrole
Helttunen, Kaisa (Wiley-VCH Verlag, 2022)A calix[4]pyrrole receptor bearing two proximally meso - meso linking isophthaloyl straps displays open and closed states depending on the calix[4]pyrrole conformation. In the crystal structures and in non-polar solvent, ... -
Binding of ion pairs and neutral guests by aryl-extended meso‑p-hydroxyphenyl calix[4]pyrrole : The interplay between three binding sites
Pamuła, Małgorzata; Bulatov, Evgeny; Helttunen, Kaisa (Elsevier BV, 2023)An aryl-extended calix[4]pyrrole with four meso‑p-hydroxyphenyl substituents was investigated as a host for chloride, acetate, and benzoate anions. Crystal structures of pyridinium and imidazolium chloride complexes were ... -
CCDC 1524101: Experimental Crystal Structure Determination
Helttunen, Kaisa; Nissinen, Maija (University of Jyväskylä; Contact details: Open Science Centre, University of Jyväskylä, email: jyx@jyu.fi, website: https://osc.jyu.fi/en, 2017) -
CCDC 264161: Experimental Crystal Structure Determination
Nissinen, Maija; Falabu, D.; Rissanen, Kari (University of Jyväskylä; Contact details: Open Science Centre, University of Jyväskylä, email: jyx@jyu.fi, website: https://osc.jyu.fi/en, 2017)
Ellei toisin mainittu, julkisesti saatavilla olevia JYX-metatietoja (poislukien tiivistelmät) saa vapaasti uudelleenkäyttää CC0-lisenssillä.