University of Jyväskylä | JYX Digital Repository

  • English  | Give feedback |
    • suomi
    • English
 
  • Login
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
View Item 
  • JYX
  • Opinnäytteet
  • Pro gradu -tutkielmat
  • View Item
JYX > Opinnäytteet > Pro gradu -tutkielmat > View Item

Tietokoneistettu NMR-spektroskopia : uuden sukupolven käyttöliittymä ja spektrianalyysi

Thumbnail
View/Open
4.7 Mb

Downloads:  
Show download detailsHide download details  
Authors
Laatikainen, Pekka
Date
2017
Discipline
Orgaaninen kemiaOrganic Chemistry

 
Korkean resoluution NMR-spektroskopia eroaa muista molekyylispektroskopioista siinä, että jopa kaikkein monimutkaisimmat, tuhansista yksittäisistä spektriviivoista muodostuvat spektrit voidaan esittää vain muutaman parametrin avulla käyttämällä kvanttimekaanista teoriaa. Tietokoneistetun NMR-spektrianalyysin tarkoituksena on määrittää nämä parametrit havaitusta spektristä kvanttimekaanisen spektrianalyysin (QMSA) avulla. Tutkielmassa käydään läpi tietokoneistetun NMR-spektroskopian taustahistoriaa ja teoriaa sekä sivutaan sen eri käyttökohteita. Tutkielman kokeellisessa osassa luotiin käyttöliittymä (ChemAdder) tietokoneistettuun NMR-spektroskopiaan erikoistuneeseen tietokoneohjelmaan, joka toimii yhdessä laskutoimituksia tekevän Fortran-ohjelman (SpinAdder) kanssa. Ohjelma soveltuu hyvin myös perinteiseen spektrianalyysiin, ja se tukee tällä hetkellä JCAMP-DX-spektriformaattia (1D ja 2D). Käyttöliittymä toteutettiin Qt:lla, joka on moderni alustariippumaton ohjelmistojen ja graafisten käyttöliittymien C++ kehitysympäristö. QMSA:n yksi lupaavimmista sovellutuksista on erilaisten seosten, kuten biologisten nesteiden kvantitatiivinen analyysi. Ohjelman avulla voidaan rakentaa, tallentaa ja käyttää tehokkaasti adaptiivisia spektrikirjastoja (ASL), jotka sisältävät esimerkiksi metaboliittien spektrit parametritiedostoina. Parametritiedostojen koko on murto-osa alkuperäisistä spektreistä ja niitä käyttämällä analyysissä tarvittavat varsinaiset spektrit voidaan simuloida hetkessä missä tahansa kentässä, käyttämällä mitä tahansa juovan muotoa tai leveyttä. Ohjelman sisältämä ASL-apuri mahdollistaa lähes automaattisen suurienkin spektriaineistojen käsittelyn muutamalla klikkauksella spektridatasta pylväsdiagrammiin ja CSV-tiedostoon. ChemAdder-projektin kotisivu, posteriesitys ja video löytyvät osoitteesta http://chemadder.com. ...
Keywords
NMR kvantitatiivinen NMR-spektroskopia
URI

http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201706223022

Metadata
Show full item record
Collections
  • Pro gradu -tutkielmat [24534]

Related items

Showing items with similar title or keywords.

  • Sequential assignment of the intrinsically disordered protein bacterial interleukin receptor 1 with nuclear magnetic resonance spectroscopy 

    Salovaara, Santeri (2018)
    Significance of intrinsic disorder in biological systems, nuclear magnetism and different methods for its use in protein structure determination have been reviewed. These methods include the use of different detection ...
  • Sequential assignment of the intrinsically disordered protein bacterial interleukin receptor 1 with nuclear magnetic resonance spectroscopy 

    Salovaara, Santeri (2018)
    Significance of intrinsic disorder in biological systems, nuclear magnetism and different methods for its use in protein structure determination have been reviewed. These methods include the use of different detection ...
  • Dihypoiodites stabilised by 4-ethylpyridine through O–I–N halogen bonds 

    Kramer, Eric; Yu, Shilin; Ward, Jas S.; Rissanen, Kari (Royal Society of Chemistry (RSC), 2021)
    Four bis(O–I–N) compounds have been synthesised from various dihypoiodites and 4-ethylpyridine. The compounds were characterised in both the solution and solid states by NMR spectroscopy (1H, 15N), X-ray diffraction, and ...
  • NMR structure of a non-conjugatable, ADP-ribosylation associated, ubiquitin-like domain from Tetrahymena thermophila polyubiquitin locus 

    Chiarini, Valerio; Tossavainen, Helena; Sharma, Vivek; Colotti, Gianni (Elsevier, 2019)
    Background. Ubiquitin-like domains (UbLs), in addition to being post-translationally conjugated to the target through the E1-E2-E3 enzymatic cascade, can be translated as a part of the protein they ought to regulate. As ...
  • Dynamic Stabilization of the Ligand-Metal Interface in Atomically Precise Gold Nanoclusters Au68 and Au144 Protected by meta-Mercaptobenzoic Acid 

    Tero, Tiia-Riikka; Malola, Sami; Koncz, Benedek; Pohjolainen, Emmi; Lautala, Saara; Mustalahti, Satu; Permi, Perttu; Groenhof, Gerrit; Pettersson, Mika; Häkkinen, Hannu (American Chemical Society, 2017)
    Ligand-stabilized, atomically precise gold nanoclusters with a metal core of a uniform size of just 1-3 nm constitute an interesting class of nanomaterials with versatile possibilities for applications due to their ...
  • Browse materials
  • Browse materials
  • Articles
  • Conferences and seminars
  • Electronic books
  • Historical maps
  • Journals
  • Tunes and musical notes
  • Photographs
  • Presentations and posters
  • Publication series
  • Research reports
  • Research data
  • Study materials
  • Theses

Browse

All of JYXCollection listBy Issue DateAuthorsSubjectsPublished inDepartmentDiscipline

My Account

Login

Statistics

View Usage Statistics
  • How to publish in JYX?
  • Self-archiving
  • Publish Your Thesis Online
  • Publishing Your Dissertation
  • Publication services

Open Science at the JYU
 
Data Protection Description

Accessibility Statement

Unless otherwise specified, publicly available JYX metadata (excluding abstracts) may be freely reused under the CC0 waiver.
Open Science Centre