Näytä suppeat kuvailutiedot

dc.contributor.advisorTurkki, Paula
dc.contributor.advisorMarjomäki, Varpu
dc.contributor.authorSallinen-Dal Maso, Heidi
dc.date.accessioned2017-06-08T16:43:34Z
dc.date.available2017-06-08T16:43:34Z
dc.date.issued2017
dc.identifier.otheroai:jykdok.linneanet.fi:1703983
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/54383
dc.description.abstractEnterovirukset ovat pieniä, vaipattomia, yksijuosteisia RNA-viruksia, jotka infektoivat yleisesti ihmisiä. Ne aiheuttavat laajan kirjon lieviä sekä vakavia oireita että taudinkuvia, muun muassa flunssan oireita, sydänlihastulehdusta sekä kroonisia tauteja. Tyypillisesti enterovirusinfektio johtaa nopeaan solun hajoamiseen ja viruspartikkelien vapautumiseen solukuoleman kautta. Tutkimustieto viittaa kuitenkin siihen, että enterovirukset kykenisivät myös pysyvään infektiomuotoon, jossa soluviljelmä pysyy elossa virusinfektiosta huolimatta. Tätä infektiomuotoa ei kuitenkaan ole vielä paljoa tutkittu eikä esimerkiksi tiedetä miten infektio näistä soluista leviää. Pysyvä enterovirusinfektio on yhdistetty esimerkiksi ykköstyypin diabetekseen tehden siitä ajankohtaisen tutkimuskohteen. Työn tarkoituksena oli tutkia kahta eri coxsackievirusperheeseen kuuluvaa enterovirusta (CVB3, CVB5) kahdessa erilaista solutyyppiä edustavassa ihmissolulinjassa (A549, RD). Virusinfektioista haluttiin määrittää uusien viruspartikkeleiden muodostumisen sekä genomin monistumisen kinetiikkaa, solukuoleman ajoitusta ja infektion leviämismekanismia. Luminesenssiin perustuvat elävyysmittaukset osoittivat, että molemmat virukset tappoivat A549-soluviljelmät hyvinkin nopeasti CVB3 24 tuntiin mennessä ja CVB5 72 tuntiin mennessä osoittaen kyseessä olevan solut tappava infektio. RD-soluviljelmät pysyivät elossa useita päiviä virusinfektiosta huolimatta viitaten kyseessä olevan pysyvä infektiomalli. Immunofluoresenssileimaukset ja konfokaalimikroskopia osoittivat, että A549-soluissa molemmilla viruksilla genomien monistuminen sekä uusien viruspartikkelien tuotto oli tehokasta. Ajallisesti virukset kuitenkin käyttäytyivät eri tavalla: CVB5 oli huomattavasti hitaampi merkittävän virustuoton ilmetessä vasta 12 tuntia infektion aloituksesta, kun taas CVB3:lla sama tilanne nähtiin jo kuusi tuntia infektion aloituksesta. RD-soluissa molemmat virukset olivat hitaampia kuin A549-soluissa. Lisäksi vain pieni osa soluista vaikutti infektoituvan viruksilla mikä näkyi RD-soluissa CVB3:lla alle 20 % ja CVB5:llä alle 10 % infektiotehokkuutena 6-96 tunnin aikavälillä kun tarkasteltiin virusgenomin monistumista. Kapsidien tuotto seurasi tätä samaa linjaa CVB3:lla kun taas CVB5:llä alle 20 % soluista näytti olevan positiivisia virustuoton suhteen aikavälillä 6-48 tuntia kunnes yllättäen 96 tuntia infektiosta CVB5-kapsidille positiivisia RD-soluja olikin 58 % populaatiosta. Tämä yllättävä piikki ei ollut näkyvissä virusgenomin monistumispositiivisissa soluissa tarkoittaen, että nämä olivat luultavimmin virusgenomin monistumista ilmentävistä soluista siirtyneitä viruksia. Samaa ilmiötä ei havaittu CVB3-infektiossa viitaten eroavaisuuksiin virusten leviämismekanismeissa tässä solulinjassa. Myös kapsidileiman ja tuotettujen kapsidien sijainti soluissa oli erilainen CVB3- ja CVB5-infektioissa, mikä viittaa siihen, että näillä viruksilla on eri leviämisstrategiat. Lisäksi alustavat kokeet antoivat viitteitä, että RD-solut erittävät viruksia CVB3- ja CVB5-infektioiden aikana ilman solukuolemaa. Kaiken kaikkiaan työssä havaittiin kahta erilaista infektiomekanismia: tappavaa ja pysyvää. Molemmissa malleissa havaittiin viruksen siirtymistä uusiin soluihin ilman solujen hajoamista mahdollisesti kalvorakkulavälitteisesti. RD-solujen pysyvä CVB5-infektio kaipaisi lisäkokeita, jotta ymmärrettäisiin uusien viruspartikkeleiden siirtyminen valtaosaan soluista hyvinkin yhtäkkisesti useita päiviä infektion aloituksen jälkeen.fi
dc.description.abstractEnteroviruses are small, non-enveloped, single-stranded RNA-viruses. They are one of the most common human pathogens. They cause a wide variety of mild and severe symptoms and diseases, such as common cold, myocarditis and different chronic diseases. Typically enterovirus infection quickly leads to the release of virus particles via cell death called cell lysis. However, research indicates that enteroviruses are also capable of causing persistent infection in which the cell culture stays alive despite of virus infection. This form of infection is not yet widely studied and for example it is not known how the infection spreads from these cells. Persistent enterovirus infection has been linked to type I diabetes making it an interesting research subject. The goal of this study was to examine two different enteroviruses (CVB3, CVB5) that belong to the family of coxsackieviruses, in two human cell lines that represent two different cell types (A549, RD). The goal was to determine the kinetics of forming new virus particles and replication, the timing of the cell death and the spreading mechanism of the infection. Cell viability test based on luminescence showed that both viruses killed A549 cell cultures quickly: CVB3 by 24 hours and CVB5 by 72 hours. This showed that the infection in question was lytic. RD cell cultures stayed alive for several days despite of the virus infection which indicates persistent infection model. Immunofluorescence labelling and confocal microscopy showed that in A549 cells the replication and the production of new virus particles were efficient with both viruses despite the viruses behaving differently in regards of time. CVB5 was considerably slower with significant virus production appearing only 12 hours post infection. The CVB3 was in a similar situation already in 6 hours post infection. In RD cells both viruses were slower than in A549 cells. Only a subpopulation off RD cells seemed to be infected with the viruses. This was shown in CVB3 with less than 20 % and in CVB5 with less than 10 % infected cells in a time span of 6-96 hours during which the replication was examined. Similar results were shown with production of capsids in CVB3. In CVB5 infection less than 20 % of cells showed positive for capsids labeling during a time span of 6-48 hours. Surprisingly though, 96 hours post infection 58 % of the RD cell population were CVB5 capsid positive cells. This surprising spike was not seen in the replication positive cells, which means that these were probably viruses transferred from the cells that show replication. This phenomenon was not seen during CVB3 infection meaning that the viruses have different spreading mechanisms in this cell line. The location of the capsids label was also different in CVB3 and CVB5 infections suggesting that these viruses have different spreading mechanisms. Additionally, preliminary tests indicate that RD cells produce viruses during CVB3 and CVB5 infections without cell lysis. All in all, in this study two different infection mechanisms (lytic and persistent) were examined. In both models viruses were observed to transfer to new cells without cell death, possibly via vesicle spreading. The persistent CVB5 infection of RD cells needs additional testing as to understand the spreading of new virus particles into majority of cells suddenly several days post infection.en
dc.format.extent1 verkkoaineisto (57 sivua)
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isofin
dc.rightsJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.rightsThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.subject.otherCoxsackievirus B3
dc.subject.otherCoxsackievirus B5
dc.subject.othereksosomit
dc.subject.othersolunulkoiset kalvorakkulat
dc.titleViruksen infektiomekanismi ja leviäminen enterovirusinfektion aikana
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-201706082754
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.type.ontasotMaster’s thesisen
dc.contributor.tiedekuntaMatemaattis-luonnontieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sciencesen
dc.contributor.laitosBio- ja ympäristötieteiden laitosfi
dc.contributor.laitosDepartment of Biological and Environmental Scienceen
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.oppiaineSolu- ja molekyylibiologiafi
dc.contributor.oppiaineCell and molecular biologyen
dc.date.updated2017-06-08T16:43:34Z
dc.rights.accesslevelrestrictedAccessfi
dc.type.publicationmasterThesis
dc.contributor.oppiainekoodi4013
dc.subject.ysoinfektiot
dc.format.contentfulltext
dc.rights.accessrightsAineistoon pääsyä on rajoitettu tekijänoikeussyistä. Aineisto on luettavissa Jyväskylän yliopiston kirjaston arkistotyöasemalta. Ks. https://kirjasto.jyu.fi/fi/tyoskentelytilat/laitteet-ja-tilat.fi
dc.rights.accessrightsThis material has a restricted access due to copyright reasons. It can be read at the workstation at Jyväskylä University Library reserved for the use of archival materials: https://kirjasto.jyu.fi/en/workspaces/facilities.en
dc.type.okmG2


Aineistoon kuuluvat tiedostot

Thumbnail

Aineisto kuuluu seuraaviin kokoelmiin

Näytä suppeat kuvailutiedot