Pigment analysis in Sphingomonas glacialis strain S2U11 and its light exposure effect

Hapellisissa oloissa happea tuottamattomat fotosynteettiset (AAP-) bakteerit saavat kemiallista energiaa hyödyntämällä valoa happea tuottamattomassa fotosynteesissä. Hapellinen ympäristö on tarpeellinen bakteeriklorofyllien ja karotenoidien valmistukseen, jotka absorboivat valoa valonkeräyskomplekseissa, mistä valon virittämä energia siirretään reaktiokeskuksiin eksitaatioenergiansiirto-prosessilla. Bakteeriklorofylli absorboi valoa infrapuna-alueelta ja karotenoidit 400–550 nm alueelta. Karotenoidit voivat siirtää viritysenergian bakteeriklorofylleille. Toisaalta, karotenoidit suojelevat komplekseja reaktiiviselta hapelta poistamalla ylimääräisen viritysenergian. AAP-bakteereja sekä niiden pigmenttien tutkimus on vähäistä, tämä tutkimus kehittää menetelmää pigmenttien analysointiin. Pigmentit eluoitiin Sphingomonas glacialis -bakteereista. Identifiointi tehtiin korkean erottelykyvyn nestekromatografian retentioajoilla sekä absorptiospektreillä. Fotosynteettisten pigmenttien kartoitus tehtiin fluoresenssieksitaatiolla. Valo-olosuhteiden muutokset vaikuttivat pigmentteihin ja runsain kasvu tapahtui pimeässä. Pigmenttejä löytyi runsaasti, mutta yksikään ei ollut fotosynteettinen. Pigmenttien analysointimenetelmä on toimiva ja käytettävissä muihin AAP-bakteereihin, mutta karotenoidien tunnistamisessa on vielä käytännön haasteita.