Näytä suppeat kuvailutiedot

dc.contributor.advisorLindström, Leena
dc.contributor.advisorVehniäinen, Eeva-Riikka
dc.contributor.authorKiviö, Ronja
dc.date.accessioned2020-07-30T07:49:59Z
dc.date.available2020-07-30T07:49:59Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/71290
dc.description.abstractTorjunta-aineiden käyttö on lisännyt niille vastustuskykyisten lajien määrää ympäri maailmaa. Torjunta-ainevastustuskykyyn on yhdistetty mm. ATP:tä sitovat kasettikuljettimet (ABC), jotka esimerkiksi poistavat myrkyllisiä yhdisteitä solusta. Koloradonkuoriainen, Leptinotarsa decemlineata, on laajalle levinnyt haitallinen tuholainen, joka käyttää ravintonaan mm. perunaa, ja sen torjuminen on vaikeaa, sillä se on vastustuskykyinen vähintään 56 torjunta-aineelle. Tavoitteenani oli tunnistaa ABC-geenejä koloradonkuoriaisen perimästä, sekä selvittää, ovatko ne yhteydessä sen torjunta-ainevastustuskykyyn. Tutkin 1) vaikuttavatko atsinfossimetyyli (AZ; organofosfaatti) ja karbaryyli (CAR; karbamaatti) ABCgeenin ilmentymiseen, sekä 2) eroaako niiden ilmentyminen torjunta-aineille vastustuskykyisen (Vermont, U.S.A) ja alttiimman (Belchow, Puola) populaation välillä. 18 yksilöä (yht. 36) kummastakin populaatiosta altistettiin joko torjuntaaineelle tai asetonille (kontrolli). Eristin RNA:n, valmistin komplementaarista DNA:ta ja analysoin kuuden ABC-geenin (ABCBmember6, ABCBmember7, ABCC13, ABCG1041A, ABCH278B, ABCH278C) ilmentymistasoja qPCRmenetelmällä. Sekä AZ että CAR voimistivat kaikkien ABC-geenien ilmentymistä. AZ-käsittelyn jälkeen ABCBmember6-geeni ilmentyi vastustuskykyisessä populaatiossa enemmän, kun taas ABCC13 ilmentyminen oli suurempaa alttiissa populaatiossa. Ilmentymisessä ei havaittu eroja populaatioiden välillä CAR- tai kontrollikäsittelyn jälkeen. Kaiken kaikkiaan ABC-geenit vaikuttavat olevan tärkeitä kuoriaisen suojaamisessa torjunta-aineilta. Etenkin ABCBmember6 on vahva ehdokas organofosfaattivastustuskyvyn osatekijäksi koloradonkuoriaisella.fi
dc.description.abstractInsecticide resistance is a global issue caused by ever-increasing use of insecticides. One gene-family linked to the resistance is the family of ATP-binding cassette (ABC) transporters which e.g. excrete toxins from the cytoplasm. The Colorado potato beetle (CPB), Leptinotarsa decemlineata, is a widespread pest species. CPB causes massive losses to for instance potato crops and is hard to control due to its high resistance to insecticides: the beetle is known to be resistant to 56 insecticides. My aim was to identify ABC genes in the genome of CPB and find out if they are linked to insecticide resistance. I wanted to know 1) if azinphos-methyl (AZ; organophosphate) and carbaryl (CAR; carbamate) influence the expression of ABC genes in CPB and 2) whether the expressions differ between resistant (Vermont, U.S.A.) and more susceptible (Belchow, Poland) populations. 18 individuals (total 36) from each population were treated with either an insecticide or acetone (control). I extracted their RNA, synthesized cDNA, and performed qPCR with primers of six different ABC genes (ABCBmember6, ABCBmember7, ABCC13, ABCG1041A, ABCH278B, ABCH278C). Exposure to both AZ and CAR elevated the expression rates of all ABC genes across the populations. After AZ treatment, ABCBmember6 was more upregulated in the resistant population, whereas ABCC13 was more upregulated in the sensitive one. The gene expressions did not differ between the populations in either CAR or control groups. My study supports the importance of ABC genes in protecting CPB against these insecticides. Especially ABCBmember6 is a probable candidate for being a part of organophosphate resistance in the beetle.en
dc.format.extent44
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isoen
dc.subject.otherinsecticide resistance
dc.subject.otherazinphos-methyl
dc.subject.othercarbaryl
dc.subject.otherorganophosphate
dc.subject.otherqPCR
dc.titleThe link between ABC genes and insecticide resistance in Leptinotarsa decemlineata
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-202007305438
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.type.ontasotMaster’s thesisen
dc.contributor.tiedekuntaMatemaattis-luonnontieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sciencesen
dc.contributor.laitosBio- ja ympäristötieteiden laitosfi
dc.contributor.laitosDepartment of Biological and Environmental Scienceen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.oppiaineEkologia ja evoluutiobiologiafi
dc.contributor.oppiaineEcology and evolutionary biologyen
dc.rights.copyrightJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.rights.copyrightThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.type.publicationmasterThesis
dc.contributor.oppiainekoodi4011
dc.subject.ysokarbamaatit
dc.subject.ysogeeniekspressio
dc.subject.ysogeenit
dc.subject.ysoinsektisidit
dc.subject.ysotorjunta-aineet
dc.subject.ysotuhohyönteiset
dc.subject.ysotorjunta
dc.subject.ysokoloradonkuoriainen
dc.subject.ysotuhoeläimet
dc.subject.ysoaakkoset
dc.subject.ysogenomiikka
dc.subject.ysocarbamates
dc.subject.ysogene expression
dc.subject.ysogenes
dc.subject.ysoinsecticides
dc.subject.ysopesticides
dc.subject.ysoinsect pests
dc.subject.ysocontrol (prevention)
dc.subject.ysoColorado potato beetle
dc.subject.ysopests
dc.subject.ysoABC
dc.subject.ysogenomics
dc.format.contentfulltext
dc.rights.accessrightsTekijä ei ole antanut lupaa avoimeen julkaisuun, joten aineisto on luettavissa vain Jyväskylän yliopiston kirjaston arkistotyösemalta. Ks. https://kirjasto.jyu.fi/fi/tyoskentelytilat/laitteet-ja-tilat..fi
dc.rights.accessrightsThe author has not given permission to make the work publicly available electronically. Therefore the material can be read only at the archival workstation at Jyväskylä University Library (https://kirjasto.jyu.fi/en/workspaces/facilities).en
dc.type.okmG2


Aineistoon kuuluvat tiedostot

Thumbnail

Aineisto kuuluu seuraaviin kokoelmiin

Näytä suppeat kuvailutiedot