University of Jyväskylä | JYX Digital Repository

  • English  | Give feedback |
    • suomi
    • English
 
  • Login
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
View Item 
  • JYX
  • Opinnäytteet
  • Väitöskirjat
  • View Item
JYX > Opinnäytteet > Väitöskirjat > View Item

Biochemical and structural comparison of spleen tyrosine kinase interaction with integrin and the immunoreceptor tyrosine-based activation motif

Thumbnail
View/Open
5.4Mb

Downloads:  
Show download detailsHide download details  
Published in
JYU Dissertations
Authors
Antenucci, Lina
Date
2019

 
Spleen tyrosine kinase (Syk) is a non-receptor tyrosine kinase involved in many different signalling pathways activated by immunoreceptors and integrins. The Syk activation mediated by phosphorylated Immunoreceptor Tyrosine-based Activation Motif (pITAM) receptors involves Src homology 2 (SH2) regulatory domains leading to Syk structural rearrangements. Differently, integrin cytoplasmic domains bind to the regulatory domain of Syk and the interaction does not require the phosphorylation, but the molecular mechanism is still unknown. This work focussed on describing the mechanism of integrin-Syk interaction and on how integrins activate Syk. First, using a fluorescent-based kinetic assay we showed that the soluble integrin peptide had no detectable effect on Syk activity, whereas Syk was activated by clustered integrin peptides. This suggests that autophosphorylation is involved in the integrin-induced activation process. Clustered integrins had also a synergic effect combined with pITAM. Next, we wanted to elucidate the molecular mechanism of Syk-integrin interaction. Surface plasmon resonance techniques was used to measure the binding affinities of different Syk constructs towards the integrin peptide. The N-terminal SH2 domain (N-SH2) plus the interdomain A (IA) segment had a comparable binding affinity to the two SH2 domains, whereas N-SH2 was a weak binder. Using nuclear magnetic resonance spectroscopy, we solved the structure of the N-SH2 domain of Syk and analysed the changes on the chemical environments of the N-SH2 domain induced by the integrin peptide and pITAM. The results indicate that integrin and pITAM binding induce changes on the same surface of the protein. In line with this, surface plasmon resonance experiments showed that the integrin and pITAM peptides compete for binding to the regulatory domain of Syk. We compared the binding affinity of pITAM to N-SH2 with C-terminal SH2 (C-SH2) domains observed that N- SH2 had a very low binding affinity compared to C-SH2. These studies suggest that integrin and pITAM-mediated Syk activation are independent of each other but may cause synergistic activation responses at the cellular level. ...
 
Pernan tyrosiinikinaasi (engl. spleen tyrosine kinase), Syk, on solunsisäinen entsyymi, joka osallistuu immuunireseptoreiden ja integriiniperheen solun tarttumisreseptoreiden välittämään solun toiminnan säätelyyn. Immuunireseptoreiden aiheuttama Syk-entsyymin aktivaatio perustuu reseptoreihin liittyvään fosforyloituvaan proteiinialueeseen nimeltään pITAM (engl. phosphorylated Immunoreceptor Tyrosine-based Activation Motiv). Immunoreseptoreiden kiinnittyessä solun ulkoisiin vastinmolekyyleihinsä, Syk kiinnittyy pITAM-alueeseen reseptorin solunsisäisessä osassa. Tämä kiinnittyminen aiheuttaa Syk-entsyymissä rakennemuutoksen ja aktivoi sen. Tämän tutkimuksen tarkoituksena on ollut selvittää, miten integriinit saavat aikaan Syk:n aktivaation. Tutkimuksessa käytettiin yhdistelmä-DNA tekniikoilla tuotettua ja puhdistettua Syk-proteiinia sekä sen säätelyosan paloja. Entsyymiaktiivisuusmittaukset osoittivat, että liukoinen integriinipeptidi ei aktivoinut Syk-entsyymiä, mutta pITAM-peptidi aktivoi. Sen sijaan analyysikammion pintaan kiinnitetty integriinipeptidi aktivoi Syk-entsyymiä ja pystyi tehostamaan liukoisen pITAM-peptidin aiheuttamaan aktivaatiota. Tästä pääteltiin, että pITAM ja integriinit aktivoivat Syk entsyymiä eri mekanismeilla: pITAM sitoutumisen aiheuttaman rakennemuutoksen kautta ja integriinit klusteroimalla Syk-entsyymiä niin, että se pystyy fosforyloimaan itseään ja näin aktivoitumaan. Toinen lähestymistapa tutkimuksessa oli integriini- ja pITAM- peptidien sitoutumispaikkojen tarkka kartoitus Syk:n säätelyalueessa. Tähän käytettiin pintaplasmoniresonanssiin perustuvaa menetelmää ja ydinmagneettista resonanssispektroskopiaa, NMR-spektroskopiaa (engl. Nuclear Magnetic Resonance). Tutkimuksia varten myös laskettiin NMR-mittauksiin perustuva 3- ulotteinen proteiinimalli Syk:n N-SH2-domeenista. Tulokset osoittivat, että pITAM-alue sitoutuu ensisijaisesti Syk:n C-SH2-domeeniin ja toissijaisesti N- SH2-domeeniin. Integriini sen sijaan sitoutuu ensisijaisesti domeenien väliseen alueeseen ja toissijaisesti N-SH2-domeeniin. Yllätys oli, että N-SH2-domeenissa integriinin sitoutuminen aiheutti kemiallisia muutoksia lähellä pITAM:n sitoutumiskohtaan ja että pITAM-peptidi pystyi inhiboimaan Syk:n säätelyosan sitoutumista integriinipeptidiin. Kokonaisuudessaan nämä tutkimukset osoittavat, että integriinien ja pITAM-reseptoreiden aiheuttama Syk-entsyymin aktivaatimekanismit ovat osittain toisistaan riippumattomia ja voivat siten voivat siten solutasolla toimia yhteistyössä. ...
 
ISBN
978-951-39-7691-0
Contains publications
  • Artikkeli I: Antenucci, L., Hytönen, V. P., & Ylänne, J. (2018). Phosphorylated immunoreceptor tyrosine-based activation motifs and integrin cytoplasmic domains activate spleen tyrosine kinase via distinct mechanisms. Journal of Biological Chemistry, 293 (13), 4591-4602. DOI: 10.1074/jbc.RA117.000660
  • Artikkeli II: Lina Antenucci, Helena Aitio, Maarit Hellman, Jari Ylänne, and Perttu Permi. Binding studies of N- and C- terminal Src homology 2 (SH2) domains of spleen tyrosine kinase Syk with pITAM. Manuscript.
  • Artikkeli III: Lina Antenucci, Maarit Hellman, Vesa P. Hytönen, Perttu Permi, and Jari Ylänne. Integrin cytoplasmic domain and pITAM compete for spleen tyrosine kinase binding. Submitted manuscript. DOI: 10.1101/524447
Keywords
integrin ITAM Nuclear Magnetic Resonance (NMR)
URI

http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-39-7691-0

Metadata
Show full item record
Collections
  • Väitöskirjat [3040]

Related items

Showing items with similar title or keywords.

  • Structural Basis of the High Affinity Interaction between the Alphavirus Nonstructural Protein-3 (nsP3) and the SH3 Domain of Amphiphysin-2 

    Tossavainen, Helena; Aitio, Olli; Hellman, Maarit; Saksela, Kalle; Permi, Perttu (American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc., 2016)
    We show that a peptide from Chikungunya virus nsP3 protein spanning residues 1728–1744 binds the amphiphysin-2 (BIN1) Src homology-3 (SH3) domain with an unusually high affinity (Kd 24 nM). Our NMR solution complex ...
  • Structural and functional characterization of the cell wall-targeting domain of lysostaphin with NMR spectroscopy 

    Kauppinen, Linda (2018)
    Src-homologi 3 (SH3) domeenit ovat solun signaalireiteillä toimivia välttämättömiä, ei-katalyyttisiä domeeneja. Kuten monilla muilla aitotumaisten solujen proteiineilla tai domeeneilla, myös SH3-domeeneilla on homologinen ...
  • Phosphorylated immunoreceptor tyrosine-based activation motifs and integrin cytoplasmic domains activate spleen tyrosine kinase via distinct mechanisms 

    Antenucci, Lina; Hytönen, Vesa P.; Ylänne, Jari (American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2018)
    Spleen tyrosine kinase (Syk) is involved in cellular adhesion and also in the activation and development of hematopoietic cells. Syk activation induced by genomic rearrangement has been linked to certain T-cell lymphomas, ...
  • Nuclear structure functions at a future electron-ion collider 

    Aschenauer, E. C.; Fazio, S.; Lamont, M. A. C.; Paukkunen, Hannu; Zurita, P. (American Physical Society, 2017)
    The quantitative knowledge of heavy nuclei’s partonic structure is currently limited to rather large values of momentum fraction x—robust experimental constraints below x ∼ 10−2 at low resolution scale Q2 are particularly ...
  • Comparison of Microscopic Interacting Boson Model and Quasiparticle Random Phase Approximation 0νββ Decay Nuclear Matrix Elements 

    Kotila, Jenni (Frontiers Media SA, 2021)
    The fundamental nature of the neutrino is presently a subject of great interest. A way to access the absolute mass scale and the fundamental nature of the neutrino is to utilize the atomic nuclei through their rare decays, ...
  • Browse materials
  • Browse materials
  • Articles
  • Conferences and seminars
  • Electronic books
  • Historical maps
  • Journals
  • Tunes and musical notes
  • Photographs
  • Presentations and posters
  • Publication series
  • Research reports
  • Research data
  • Study materials
  • Theses

Browse

All of JYXCollection listBy Issue DateAuthorsSubjectsPublished inDepartmentDiscipline

My Account

Login

Statistics

View Usage Statistics
  • How to publish in JYX?
  • Self-archiving
  • Publish Your Thesis Online
  • Publishing Your Dissertation
  • Publication services

Open Science at the JYU
 
Data Protection Description

Accessibility Statement

Unless otherwise specified, publicly available JYX metadata (excluding abstracts) may be freely reused under the CC0 waiver.
Open Science Centre