Biochemical and structural comparison of spleen tyrosine kinase interaction with integrin and the immunoreceptor tyrosine-based activation motif
Spleen tyrosine kinase (Syk) is a non-receptor tyrosine kinase involved in many
different signalling pathways activated by immunoreceptors and integrins. The
Syk activation mediated by phosphorylated Immunoreceptor Tyrosine-based
Activation Motif (pITAM) receptors involves Src homology 2 (SH2) regulatory
domains leading to Syk structural rearrangements. Differently, integrin
cytoplasmic domains bind to the regulatory domain of Syk and the interaction
does not require the phosphorylation, but the molecular mechanism is still
unknown. This work focussed on describing the mechanism of integrin-Syk
interaction and on how integrins activate Syk. First, using a fluorescent-based
kinetic assay we showed that the soluble integrin peptide had no detectable
effect on Syk activity, whereas Syk was activated by clustered integrin peptides.
This suggests that autophosphorylation is involved in the integrin-induced
activation process. Clustered integrins had also a synergic effect combined with
pITAM. Next, we wanted to elucidate the molecular mechanism of Syk-integrin
interaction. Surface plasmon resonance techniques was used to measure the
binding affinities of different Syk constructs towards the integrin peptide. The
N-terminal SH2 domain (N-SH2) plus the interdomain A (IA) segment had a
comparable binding affinity to the two SH2 domains, whereas N-SH2 was a
weak binder. Using nuclear magnetic resonance spectroscopy, we solved the
structure of the N-SH2 domain of Syk and analysed the changes on the
chemical environments of the N-SH2 domain induced by the integrin peptide
and pITAM. The results indicate that integrin and pITAM binding induce
changes on the same surface of the protein. In line with this, surface plasmon
resonance experiments showed that the integrin and pITAM peptides compete
for binding to the regulatory domain of Syk. We compared the binding affinity
of pITAM to N-SH2 with C-terminal SH2 (C-SH2) domains observed that N-
SH2 had a very low binding affinity compared to C-SH2. These studies suggest
that integrin and pITAM-mediated Syk activation are independent of each other
but may cause synergistic activation responses at the cellular level.
...
Pernan tyrosiinikinaasi (engl. spleen tyrosine kinase), Syk, on solunsisäinen entsyymi, joka osallistuu immuunireseptoreiden ja integriiniperheen solun tarttumisreseptoreiden välittämään solun toiminnan säätelyyn. Immuunireseptoreiden aiheuttama Syk-entsyymin aktivaatio perustuu reseptoreihin liittyvään fosforyloituvaan proteiinialueeseen nimeltään pITAM (engl. phosphorylated Immunoreceptor
Tyrosine-based Activation Motiv). Immunoreseptoreiden kiinnittyessä solun ulkoisiin vastinmolekyyleihinsä, Syk kiinnittyy pITAM-alueeseen reseptorin solunsisäisessä osassa. Tämä kiinnittyminen aiheuttaa Syk-entsyymissä rakennemuutoksen ja aktivoi sen. Tämän tutkimuksen tarkoituksena on ollut selvittää, miten
integriinit saavat aikaan Syk:n aktivaation. Tutkimuksessa käytettiin yhdistelmä-DNA tekniikoilla tuotettua ja puhdistettua Syk-proteiinia sekä sen säätelyosan
paloja. Entsyymiaktiivisuusmittaukset osoittivat, että liukoinen integriinipeptidi
ei aktivoinut Syk-entsyymiä, mutta pITAM-peptidi aktivoi. Sen sijaan analyysikammion pintaan kiinnitetty integriinipeptidi aktivoi Syk-entsyymiä ja pystyi
tehostamaan liukoisen pITAM-peptidin aiheuttamaan aktivaatiota. Tästä pääteltiin, että pITAM ja integriinit aktivoivat Syk entsyymiä eri mekanismeilla:
pITAM sitoutumisen aiheuttaman rakennemuutoksen kautta ja integriinit klusteroimalla Syk-entsyymiä niin, että se pystyy fosforyloimaan itseään ja näin
aktivoitumaan. Toinen lähestymistapa tutkimuksessa oli integriini- ja pITAM- peptidien sitoutumispaikkojen tarkka kartoitus Syk:n säätelyalueessa. Tähän
käytettiin pintaplasmoniresonanssiin perustuvaa menetelmää ja ydinmagneettista resonanssispektroskopiaa, NMR-spektroskopiaa (engl. Nuclear Magnetic
Resonance). Tutkimuksia varten myös laskettiin NMR-mittauksiin perustuva 3-
ulotteinen proteiinimalli Syk:n N-SH2-domeenista. Tulokset osoittivat, että
pITAM-alue sitoutuu ensisijaisesti Syk:n C-SH2-domeeniin ja toissijaisesti N-
SH2-domeeniin. Integriini sen sijaan sitoutuu ensisijaisesti domeenien väliseen
alueeseen ja toissijaisesti N-SH2-domeeniin. Yllätys oli, että N-SH2-domeenissa
integriinin sitoutuminen aiheutti kemiallisia muutoksia lähellä pITAM:n sitoutumiskohtaan ja että pITAM-peptidi pystyi inhiboimaan Syk:n säätelyosan sitoutumista integriinipeptidiin. Kokonaisuudessaan nämä tutkimukset osoittavat, että
integriinien ja pITAM-reseptoreiden aiheuttama Syk-entsyymin aktivaatimekanismit ovat osittain toisistaan riippumattomia ja voivat siten voivat siten
solutasolla toimia yhteistyössä.
...




ISBN
978-951-39-7691-0Contains publications
- Artikkeli I: Antenucci, L., Hytönen, V. P., & Ylänne, J. (2018). Phosphorylated immunoreceptor tyrosine-based activation motifs and integrin cytoplasmic domains activate spleen tyrosine kinase via distinct mechanisms. Journal of Biological Chemistry, 293 (13), 4591-4602. DOI: 10.1074/jbc.RA117.000660
- Artikkeli II: Lina Antenucci, Helena Aitio, Maarit Hellman, Jari Ylänne, and Perttu Permi. Binding studies of N- and C- terminal Src homology 2 (SH2) domains of spleen tyrosine kinase Syk with pITAM. Manuscript.
- Artikkeli III: Lina Antenucci, Maarit Hellman, Vesa P. Hytönen, Perttu Permi, and Jari Ylänne. Integrin cytoplasmic domain and pITAM compete for spleen tyrosine kinase binding. Submitted manuscript. DOI: 10.1101/524447
Keywords
Metadata
Show full item recordCollections
- Väitöskirjat [3040]
Related items
Showing items with similar title or keywords.
-
Structural Basis of the High Affinity Interaction between the Alphavirus Nonstructural Protein-3 (nsP3) and the SH3 Domain of Amphiphysin-2
Tossavainen, Helena; Aitio, Olli; Hellman, Maarit; Saksela, Kalle; Permi, Perttu (American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc., 2016)We show that a peptide from Chikungunya virus nsP3 protein spanning residues 1728–1744 binds the amphiphysin-2 (BIN1) Src homology-3 (SH3) domain with an unusually high affinity (Kd 24 nM). Our NMR solution complex ... -
Structural and functional characterization of the cell wall-targeting domain of lysostaphin with NMR spectroscopy
Kauppinen, Linda (2018)Src-homologi 3 (SH3) domeenit ovat solun signaalireiteillä toimivia välttämättömiä, ei-katalyyttisiä domeeneja. Kuten monilla muilla aitotumaisten solujen proteiineilla tai domeeneilla, myös SH3-domeeneilla on homologinen ... -
Phosphorylated immunoreceptor tyrosine-based activation motifs and integrin cytoplasmic domains activate spleen tyrosine kinase via distinct mechanisms
Antenucci, Lina; Hytönen, Vesa P.; Ylänne, Jari (American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2018)Spleen tyrosine kinase (Syk) is involved in cellular adhesion and also in the activation and development of hematopoietic cells. Syk activation induced by genomic rearrangement has been linked to certain T-cell lymphomas, ... -
Nuclear structure functions at a future electron-ion collider
Aschenauer, E. C.; Fazio, S.; Lamont, M. A. C.; Paukkunen, Hannu; Zurita, P. (American Physical Society, 2017)The quantitative knowledge of heavy nuclei’s partonic structure is currently limited to rather large values of momentum fraction x—robust experimental constraints below x ∼ 10−2 at low resolution scale Q2 are particularly ... -
Comparison of Microscopic Interacting Boson Model and Quasiparticle Random Phase Approximation 0νββ Decay Nuclear Matrix Elements
Kotila, Jenni (Frontiers Media SA, 2021)The fundamental nature of the neutrino is presently a subject of great interest. A way to access the absolute mass scale and the fundamental nature of the neutrino is to utilize the atomic nuclei through their rare decays, ...