Show simple item record

dc.contributor.authorPullinen, Katri
dc.date.accessioned2009-04-14T14:41:30Z
dc.date.available2009-04-14T14:41:30Z
dc.date.issued2007
dc.identifier.urihttps://jyx.jyu.fi/handle/123456789/19899
dc.description.abstractPullinen, Katri 2007. Luurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky. Liikuntabiologian laitos, Jyväskylän yliopisto. Liikuntafysiologian Kandidaatin tutkielma, 49 s. Perinnöllistä kestävyyssuorituskykyä ja kestävyysharjoittelun aiheuttamia adaptaatioita voidaan tutkia geeniekspressiotasolla tekemällä microarray-analyysi. Kestävyysharjoittelun aiheuttamia adaptaatioita tutkittaessa on havaittu muun muassa mitokondrioiden biogeneesiin ja metaboliaan liittyvien geenien ilmenemisen kasvua. Kestävyyssuorituskyvyn perinnöllisyyttä ei ole tutkittu geeniekspressiotasolla ihmisillä eikä eläimillä. Ihmisillä se on erittäin hankalaa, joten sitä varten voidaan luoda eläinkantoja, joissa geneettinen ja ympäristön vaihtelu on minimoitu. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää, minkälaisia eroja löytyy perinnöllisesti korkean ja matalan juoksukapasiteetin rottien, jotka eivät harjoitelleet, luurankolihaksen geenien ilmenemisessä ja mitkä geenit tai geeniryhmät ovat yhteydessä kestävyyssuorituskykyyn. Koe-eläiminä oli geneettisesti heterogeenisten rottien (N:NIH kanta) jälkeläisiä. 12 korkean (HCR) ja 12 matalan (LCR) juoksukapasiteetin rotan m. gastrocnemiuksesta otettiin näyte microarray-analyysiä varten. Microarray-analyysissä käytettiin Illuminan RatRef-12 Expression BeadChip sirua ja tulokset analysoitiin R-kielellä ja Bioconductorin siihen lisäämillä paketeilla. Jokaiselle geenille laskettiin intensiteettiarvojen keskiarvo, keskihajonta ja kertamuutos. Kiinnostavat geenit suodatettiin perustuen muokattuun P-arvoon. Annotaatiossa käytettiin DAVID bioinformatiikka webtyökalua ja muita internetin geenitietokantasivustoja. Geenien ilmenemismuutosten määrä ja suunta laskettiin merkitsevyystasoilla 0,01, 0,05, 0,1, 0,15, 0,2 ja 0,25. Merkitsevyystasolla 0,01 31 geenin ekspressio oli kasvanut ja 23 geenin ekspressio laskenut. Suurin osa muutoksista tapahtui pienillä intensiteeteillä ja moni näistä muutoksista oli melko pieni. Merkitsevyystasolla 0,05 geenit luokiteltiin eri ryhmiin. Geenien ilmeneminen oli suurempaa HCR rotilla mitokondrioon, karboksyylihappometaboliaan, lipidimetaboliaan, oksidoreduktaasiaktiivisuuteen ja immuunivasteeseen liittyvissä geeneissä. Geenien ilmeneminen oli suurempaa LCR rotilla lipidikataboliaan, solujen tukirangan proteiinien sitoutumiseen ja proteiinimetaboliaan liittyvissä geeneissä. Tutkimuksessa havaitut geeniekspressioerot HCR ja LCR rottien välillä selittävät eroja kestävyyssuorituskyvyssä. Suuremmat ilmenemistasot lipidimetaboliaan liittyvillä geeneillä kertovat paremmasta rasvojen hajotuskyvystä ja rasvahappojen nopeammasta ja tehokkaammasta hapetuksesta, jolloin rasvoja pystytään käyttämään paremmin energianlähteenä. Myös mitokondrioiden kyky tuottaa ATP:ta on parempi, mistä kertoo sitruunahappokierron ja elektroninsiirtoketjun geenien ekspression kasvu.en_US
dc.format.extent49 s.
dc.language.isofin
dc.rightsThis publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.en
dc.rightsJulkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.fi
dc.subject.otherkestävyyssuorituskykyen_US
dc.subject.otherluurankolihasen_US
dc.subject.othergeeniekspressioen_US
dc.subject.otherperinnöllisyysen_US
dc.titleLuurankolihaksen geeniekspressio ja perinnöllinen kestävyyssuorituskyky
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:jyu-20094141436
dc.type.dcmitypeTexten
dc.type.ontasotKandidaatintutkielmafi
dc.type.ontasotBachelor's thesisen
dc.contributor.tiedekuntaLiikuntatieteellinen tiedekuntafi
dc.contributor.tiedekuntaFaculty of Sport and Health Sciencesen
dc.contributor.laitosLiikuntabiologian laitosfi
dc.contributor.yliopistoUniversity of Jyväskyläen
dc.contributor.yliopistoJyväskylän yliopistofi
dc.contributor.oppiaineLiikuntafysiologiafi
dc.rights.accesslevelopenAccessen


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record